利用原癌基因/同源盒基因逆转录病毒人cDNA文库在小鼠体内模型中鉴定白血病诱导基因的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.2h0g7

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据集大小约 283.8 MB。

数据说明

本研究的目的是开发一种方法，利用逆转录病毒cDNA文库和小鼠骨髓转导-移植系统，筛选大量急性髓系白血病（AML）的潜在驱动突变。作为概念验证，将编码已知癌基因和同源盒基因的逆转录病毒cDNA文库转导至小鼠骨髓（BM）细胞中，并将病毒转导的细胞移植到致死剂量照射的小鼠体内。通过对白血病细胞基因组DNA中cDNA插入片段的PCR扩增，鉴定了负责白血病起始的原癌基因。在对十只白血病小鼠的初步筛选中，所有白血病小鼠中均检测到了MYC原癌基因。十只白血病小鼠中，3只（30%）仅携带MYC作为转基因，7只（70%）则含有额外的原癌基因插入。为了表征其他诱导白血病的基因组合，我们从文库中移除MYC相关基因后重复了相同的实验。使用去除MYC的原癌基因文库进行的第二次筛选证实了MEIS1和HOX家族作为白血病发病过程中的协同癌基因。

我们在本研究中引入的模型系统将有助于在体内功能性地筛选具有致白血病潜力的新基因组合，并且该系统将有助于发现白血病治疗的新靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。