m6A修饰调控肠道免疫与轮状病毒感染数据集
该数据集来自 Dryad 平台，对应研究 m6A 修饰调控肠道免疫与轮状病毒感染。数据覆盖轮状病毒感染小肠上皮细胞后 m6A 修饰变化、METTL3 缺失小鼠的抗感染表型，以及 RNA-sequencing 和 m6A RIP-sequencing 鉴定 IRF7 等干扰素通路调控因子的实验内容
基本信息
资源简介
m6A修饰调控肠道免疫与轮状病毒感染数据集
m6A modifications regulate intestinal immunity and rotavirus infection
该数据集来自 Dryad 平台，对应研究 m6A 修饰调控肠道免疫与轮状病毒感染。数据覆盖轮状病毒感染小肠上皮细胞后 m6A 修饰变化、METTL3 缺失小鼠的抗感染表型，以及 RNA-sequencing 和 m6A RIP-sequencing 鉴定 IRF7 等干扰素通路调控因子的实验内容。可用于研究 m6A 修饰在肠道抗病毒免疫中的功能及轮状病毒感染机制（来源 Dryad，https://spdx.org/licenses/CC0-1.0.html 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：N6-甲基腺苷（m6A）是一种丰富的 mRNA 修饰，影响许多生物学过程。然而，在病毒感染等生理或病理过程中 m6A 水平如何被调控，以及 m6A 在肠道免疫防御病毒感染中的体内功能，在很大程度上仍不清楚。在此，我们揭示了 m6A 修饰在小肠肠上皮细胞（IECs）中抵抗轮状病毒（RV）感染的一种新型抗病毒功能。我们发现，轮状病毒感染通过下调 m6A 擦除酶 ALKBH5 诱导 mRNA 转录本上的整体 m6A 修饰。在 IECs 中缺乏 m6A 书写酶 METTL3 的小鼠（Mettl3 ΔIEC）对 RV 感染具有抵抗力，并显示干扰素（IFNs）和 IFN 刺激基因（ISGs）表达增加。利用 RNA 测序和 m6A RNA 免疫沉淀（RIP）测序，我们鉴定出 IRF7，它是 IFN 反应的主要调控因子
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：doi:10.5061/dryad.p2ngf1vr8。
【主题与分类】
主题标签：Immunology。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://doi.org/10.5061/dryad.p2ngf1vr8
使用许可：https://spdx.org/licenses/CC0-1.0.html。
下载信息
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数据集获取
源站：https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.p2ngf1vr8
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 17.2 MB。
数据说明
Anmin Wang (2022). m6A modifications regulate intestinal immunity and rotavirus infection [Dataset]. http://doi.org/10.5061/dryad.p2ngf1vr8
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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