American Crow SNPs与微卫星数据
源站描述指出，疫病流行两年间超过 50% 的标记个体消失，成体死亡率增加 10 倍；与预期相反，WNV 出现后遗传多样性（等位基因多样性与新等位基因数）上升
基本信息
资源简介
American Crow SNPs与微卫星数据
American Crow SNPs and microsatellite data
该数据集来自 Dryad，包含 American crow（Corvus brachyrhynchos）的 SNPs 与微卫星标记数据，用于检验 West Nile virus（WNV）出现前后种群的遗传瓶颈、近交与迁入水平。源站描述指出，疫病流行两年间超过 50% 的标记个体消失，成体死亡率增加 10 倍；与预期相反，WNV 出现后遗传多样性（等位基因多样性与新等位基因数）上升。数据可用于研究传染病对野生动物种群遗传结构与适应潜力的影响（来源 DOI 解析，Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2023。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：传染病可导致野生动物种群急剧下降，进而引起遗传多样性变化，这可能影响个体对感染的易感性以及种群对病原体暴发的整体韧性。本文检验了 West Nile virus（WNV）出现前后 American crow（Corvus brachyrhynchos）种群存在遗传瓶颈的证据。在该疫病流行的两年期间，超过 50% 的标记鸟类个体消失，成体死亡率增加了 10 倍。利用 SNPs 和微卫星标记分析，我们检验了遗传瓶颈的证据，并比较了 WNV 出现前和出现后种群的近交与迁入水平。与预期相反，WNV 出现后遗传多样性（等位基因多样性和新等位基因数量）增加。这可能是由于增加
【主题与分类】
主题标签：emerging infectious disease、genetic bottleneck、genetic diversity、immigration、Inbreeding、West Nile virus。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.5dv41nsbj
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.5dv41nsbj
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.3 MB。
数据说明
传染病可导致野生动物种群数量急剧下降，进而引起遗传多样性的变化，这可能影响个体对感染的易感性以及种群对病原体暴发的整体抵抗力。本文研究了西尼罗河病毒（WNV）出现前后美国乌鸦（Corvus brachyrhynchos）种群中遗传瓶颈的证据。在该流行病发生的两年期间，该种群中超过50%的标记鸟类死亡，表明成年死亡率增加了10倍。利用SNP和微卫星标记分析，我们检验了遗传瓶颈的证据，并比较了WNV感染前后种群的近交水平和迁入情况。与预期相反，WNV出现后遗传多样性（等位基因多样性和新等位基因数量）反而增加。这可能是由于迁入增加所致，因为WNV感染后种群的估计成员系数较低。
然而，与此同时，近交频率似乎有所增加：在WNV疫情后的种群中，SNP标记的平均近交系数更高，微卫星标记的杂合度-杂合度相关性更强。这些结果表明，种群水平上遗传多样性的丧失并非种群数量下降的必然结果，尤其是在存在基因流的情况下。在WNV疫情后的乌鸦中所观察到的变化，可能对它们应对未来病原体风险的反应产生截然不同的影响，可能使整个种群对不断变化的病原体群落更具韧性，同时增加对疾病易感性升高的近交个体的频率。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
