显微真菌图像 - DeFungi 数据集

该数据集来自 kaggle.com,包含 5000 张用于训练的高质量图像,图像取自酵母菌、霉菌或皮肤癣菌引起的浅表真菌感染,由专家协助人工标注为五个类别,并用自动算法裁剪

Ansh TanwarAnsh Tanwar
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2023-08-05 更新
浏览 4
医学影像分类earth and naturebiologyexploratory data analysiscomputer visiontransfer learning
Microscopic Fungi Image - DeFungi Dataset

基本信息

模态
医学影像
大小
0.094174939 GB
任务类型
分类
许可
Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)
创建/更新时间
2023-08-05
版本
v2

资源简介

显微真菌图像 - DeFungi 数据集

Microscopic Fungi Image - DeFungi Dataset

该数据集来自 kaggle.com,包含 5000 张用于训练的高质量图像,图像取自酵母菌、霉菌或皮肤癣菌引起的浅表真菌感染,由专家协助人工标注为五个类别,并用自动算法裁剪。文件夹 images 下含 H1、H2、H3、H5、H6 五个子文件夹,分别对应 Candida albicans、Aspergillus niger、Trichophyton rubrum、Trichophyton mentagrophytes、Epidermophyton floccosum。可用于真菌感染的图像分类、计算机视觉与迁移学习研究(来源 Kaggle,Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-08-05。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):概述 >本数据集附带 5000 张用于训练的高质量图像。图像来自酵母菌、霉菌或皮肤癣菌引起的浅表真菌感染。图像已由专家协助人工标注为五个类别,并经过整理。图像已用自动算法裁剪以生成最终数据集。 关键特征 文件夹 images 包含五个子文件夹,分别对应真菌的五个类别之一。子文件夹命名为 H1、H2、H3、H5 和 H6。根据 Sopo 等人的论文,这些子文件夹代表以下真菌类型: >H1: Candida albicans H2: Aspergillus niger H3: Trichophyton rubrum H5: Trichophyton mentagrophytes H6: Epidermophyton floccosum

【数据结构与技术规格】

文件数 20 个,合计 238.36 KB。

【主题与分类】

主题标签:earth and nature、biology、exploratory data analysis、computer vision、transfer learning。本站分类:感染/真菌感染。

【获取与许可】

源站页面:https://www.kaggle.com/datasets/anshtanwar/microscopic-fungi-images

使用许可:Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)。

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使用方式

数据集获取

源站:https://kaggle.com/datasets/anshtanwar/microscopic-fungi-images

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 94.2 MB。

数据说明

Ansh Tanwar (2023). Microscopic Fungi Image - DeFungi Dataset [Dataset]. https://www.kaggle.com/datasets/anshtanwar/microscopic-fungi-images

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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