临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集:寻找新型推定生物标志物研究
临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集,用于一项寻找新型推定生物标志物的研究[数据集]。主题标签:感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学、PRIDE

基本信息
资源简介
临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集:寻找新型推定生物标志物研究
该数据集为临床疑似感染性心内膜炎患者的相关支持数据,来源于一项旨在寻找新型推定生物标志物的研究,以数据集形式公开发布。数据集英文名称为“Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers”,在分类上归属于感染 / 心内膜炎方向,来源站为 ebi.ac.uk,具体收录于 PRIDE 归档项目 PXD010149 之下,由 Allan Stensballe 于 2020 年发布。围绕感染性心内膜炎这一临床诊断难点,该数据集以临床疑似病例为对象,服务于生物标志物发现研究,主题涉及感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学与 PRIDE 等关键词,可为相关领域研究者了解和使用该数据资源提供入口。
【数据集背景】
感染性心内膜炎是一种临床诊断颇具挑战的感染性疾病,早期识别与判断往往依赖多种临床信息与实验室检查的综合评估。寻找能够辅助临床 suspicion 判断的新型推定生物标志物,是该数据集所支持研究的核心目标。该数据集正是围绕临床疑似感染性心内膜炎患者而建立,作为一项搜索新型推定生物标志物研究的支持性数据资源对外发布,发布年份为 2020 年,发布者为 Allan Stensballe,收录于 PRIDE 归档项目 PXD010149。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学与 PRIDE,表明其内容与蛋白质组学分析相关,并围绕临床疑似感染性心内膜炎患者展开。数据集英文名称明确其定位为“支持临床疑似感染性心内膜炎患者”的数据集,服务于寻找新型推定生物标志物的研究。关于数据的具体样本数量、文件构成、检测指标种类等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk,具体通过 PRIDE 归档项目 PXD010149 对外提供。源站描述中给出了数据集的正式引用信息:Allan Stensballe (2020). Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149。关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于感染性心内膜炎相关生物标志物发现研究,尤其是针对临床疑似病例的蛋白质组学探索性分析。研究者可将其作为方法学参考或数据资源,用于理解以临床疑似感染性心内膜炎患者为对象的研究设计思路,也可在蛋白质组学与临床感染诊断交叉领域的数据复用、比较分析或教学演示中加以利用。关于具体适用的分析流程或统计方法,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 PRIDE 归档项目 PXD010149 提供访问,使用者可依据源站给出的项目地址获取数据。关于数据下载格式、文件组织方式、预处理步骤及配套分析工具等操作层面的说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为研究支持性数据,围绕临床疑似感染性心内膜炎患者构建,其定位是服务于新型推定生物标志物的搜索研究,而非经过临床验证的诊断产品。关于数据完整性、质控指标、缺失值情况以及样本代表性等质量层面的具体信息,源站未提供。使用者应结合自身研究目的审慎评估其适用性。
【引用与许可】
引用该数据集时,应使用源站给出的正式引用信息:Allan Stensballe (2020). Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Allan Stensballe(2020)。支持临床疑似感染性心内膜炎患者的数据集,该数据集纳入了一项寻找新型推定生物标志物的研究[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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