临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集:寻找新型推定生物标志物研究

临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集,用于一项寻找新型推定生物标志物的研究[数据集]。主题标签:感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学、PRIDE

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蛋白质分类感染性心内膜炎生物标志物临床疑似蛋白质组学PRIDE
Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

临床疑似感染性心内膜炎患者支持数据集:寻找新型推定生物标志物研究

该数据集为临床疑似感染性心内膜炎患者的相关支持数据,来源于一项旨在寻找新型推定生物标志物的研究,以数据集形式公开发布。数据集英文名称为“Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers”,在分类上归属于感染 / 心内膜炎方向,来源站为 ebi.ac.uk,具体收录于 PRIDE 归档项目 PXD010149 之下,由 Allan Stensballe 于 2020 年发布。围绕感染性心内膜炎这一临床诊断难点,该数据集以临床疑似病例为对象,服务于生物标志物发现研究,主题涉及感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学与 PRIDE 等关键词,可为相关领域研究者了解和使用该数据资源提供入口。

【数据集背景】

感染性心内膜炎是一种临床诊断颇具挑战的感染性疾病,早期识别与判断往往依赖多种临床信息与实验室检查的综合评估。寻找能够辅助临床 suspicion 判断的新型推定生物标志物,是该数据集所支持研究的核心目标。该数据集正是围绕临床疑似感染性心内膜炎患者而建立,作为一项搜索新型推定生物标志物研究的支持性数据资源对外发布,发布年份为 2020 年,发布者为 Allan Stensballe,收录于 PRIDE 归档项目 PXD010149。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括感染性心内膜炎、生物标志物、临床疑似、蛋白质组学与 PRIDE,表明其内容与蛋白质组学分析相关,并围绕临床疑似感染性心内膜炎患者展开。数据集英文名称明确其定位为“支持临床疑似感染性心内膜炎患者”的数据集,服务于寻找新型推定生物标志物的研究。关于数据的具体样本数量、文件构成、检测指标种类等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,具体通过 PRIDE 归档项目 PXD010149 对外提供。源站描述中给出了数据集的正式引用信息:Allan Stensballe (2020). Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149。关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于感染性心内膜炎相关生物标志物发现研究,尤其是针对临床疑似病例的蛋白质组学探索性分析。研究者可将其作为方法学参考或数据资源,用于理解以临床疑似感染性心内膜炎患者为对象的研究设计思路,也可在蛋白质组学与临床感染诊断交叉领域的数据复用、比较分析或教学演示中加以利用。关于具体适用的分析流程或统计方法,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 PRIDE 归档项目 PXD010149 提供访问,使用者可依据源站给出的项目地址获取数据。关于数据下载格式、文件组织方式、预处理步骤及配套分析工具等操作层面的说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为研究支持性数据,围绕临床疑似感染性心内膜炎患者构建,其定位是服务于新型推定生物标志物的搜索研究,而非经过临床验证的诊断产品。关于数据完整性、质控指标、缺失值情况以及样本代表性等质量层面的具体信息,源站未提供。使用者应结合自身研究目的审慎评估其适用性。

【引用与许可】

引用该数据集时,应使用源站给出的正式引用信息:Allan Stensballe (2020). Dataset in support of patients on clinical suspicion of infective endocarditis included in a study searching for novel putative biomarkers [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Allan Stensballe(2020)。支持临床疑似感染性心内膜炎患者的数据集,该数据集纳入了一项寻找新型推定生物标志物的研究[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010149

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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