脊髓刺激装置相关感染中金黄色葡萄球菌生物膜介导的抗生素耐受性

脊髓刺激装置相关感染中金黄色葡萄球菌生物膜介导抗生素耐受性研究,含全基因组测序和药敏表型分析。

NIAID Data Ecosystem
浏览 14
基因组脊髓刺激装置相关感染全基因组测序
Biofilm-mediated Antibiotic Tolerance in Staphylococcus aureus from Spinal Cord Stimulation Device-Related Infections

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-16

资源简介

该数据集来自NIAID Data Ecosystem,研究对象为脊髓刺激装置(SCS)相关感染中的金黄色葡萄球菌。研究探索浮游和生物膜生长分离株的生物膜基质组成和抗菌药物敏感性,采用全基因组测序(WGS)分析基因型、毒力组、耐药组和泛基因组结构,并分析生物膜基质组成、早期表面黏附、溶血活性和抗生素敏感性测试。结果显示分离株具有遗传多样性,所有分离株均携带生物膜相关icaA/D基因并能在体外形成生物膜;oxacillin、teicoplanin和rifampin对金黄色葡萄球菌生物膜抗菌效果最高,而vancomycin、trimethoprim/sulfamethoxazole和levofloxacin的耐受性高。用途:支持SCS相关金黄色葡萄球菌生物膜感染机制、毒力、耐药特征及抗生素选择研究。

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数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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