MGYS00006815:EMG产生的PRJEB41539数据集的TPA宏基因组组装(大动脉炎肠道微生物组、代谢组和脂质组改变)
第三方注释(TPA)组装来源于原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJEB41539,并使用 metaspades v3.15.3 组装

基本信息
资源简介
MGYS00006815:EMG产生的PRJEB41539数据集的TPA宏基因组组装(大动脉炎肠道微生物组、代谢组和脂质组改变)
第三方注释(TPA)组装来源于原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJEB41539,并使用 metaspades v3.15.3 组装
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):第三方注释(TPA)组装来源于原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJEB41539,并使用 metaspades v3.15.3 组装。该项目包括来自以下生物群落的样本:root:Host-associated:Human:Digestive system:Large intestine:Fecal。
【主题与分类】
主题标签:宏基因组、全基因组测序、粪便样本、序列组装、大动脉炎、心血管疾病、肠道菌群、多组学分析。本站分类:心血管系统疾病/血管炎。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00006815
下载信息
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源站:https://ebi.ac.uk/metagenomics/studies/MGYS00006815
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
第三方注释(TPA)组装来源于原始全基因组鸟枪法(WGS)数据集 PRJEB41539,并使用 metaspades v3.15.3 组装。该项目包括来自以下生物群落的样本:root:Host-associated:Human:Digestive system:Large intestine:Fecal。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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