基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

人胎儿成骨细胞系hFOB全基因组测序

PRJNA1455685 是一个围绕人胎儿成骨细胞（hFOB）细胞系开展全基因组测序的 BioProject 记录，收录于 NCBI 的 BioProject 数据库，本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他方向。该记录本身并不直接承载测序读段或分析结果，而是作为一项研究计划的登记入口，把与该计划相关的各类生物数据链接汇聚于一处，便于研究者从单一位置检索和访问。BioProject 的定位是：与单一计划相关、源自单一组织或联合体的生物数据的集合，其记录为用户提供查找该计划所产生的多种数据类型链接的统一入口。对于关注成骨细胞基因组基础数据、骨骼相关研究或细胞系基因组参考信息的使用者而言，该条目可作为定位原始数据与相关资源的起点。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 “PRJNA1455685: Whole genome sequencing of the human fetal osteoblast (hFOB) cell line”，源站标题为 “Whole genome sequencing of the human fetal osteobl... (ID 1455685) - BioProject - NCBI”。从名称可以看出，该计划的核心对象是人胎儿成骨细胞（hFOB）细胞系，研究类型为全基因组测序。BioProject 作为 NCBI 提供的项目登记体系，其设计目的是把由单一组织或联合体发起、围绕同一研究计划产生的生物数据集中登记，使用户不必在多个分散的数据资源之间反复检索。本站将该条目归入肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类，提示其与骨骼、成骨细胞相关的研究语境存在关联。关于该计划的具体发起机构、资助来源、所属联合体以及研究背景的进一步说明，源站未提供。

【数据内容】

依据该计划的名称，其数据内容指向人胎儿成骨细胞（hFOB）细胞系的全基因组测序。BioProject 记录的作用是提供指向该计划所产生的各类数据类型的链接，因此该条目本身是数据类型的汇聚入口，而非某一单独的数据文件。除全基因组测序这一研究类型外，该计划具体包含哪些数据文件、样本数量、测序平台、覆盖深度、数据体量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，登记形式为 BioProject，项目编号为 PRJNA1455685。BioProject 的通用定义说明，其记录源自单一组织或联合体，并围绕单一计划汇集生物数据。就本条目而言，样本采集方式、细胞系来源背景、建库与测序的具体流程、数据处理步骤等信息，源站未提供。

【适用场景】

该条目可作为查找人胎儿成骨细胞（hFOB）细胞系全基因组测序相关数据链接的入口，适用于需要定位该计划所产生数据的研究者。由于 BioProject 记录提供指向多种数据类型的链接，使用者可借助该条目进入与该计划相关的数据资源。关于该数据在骨骼疾病研究、成骨细胞功能研究或细胞系基因组参考中的具体应用方式与适用边界，源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1455685 或标题关键词进行检索，进入该记录后，利用其中提供的链接访问该计划产生的各类数据。BioProject 的设计即为用户提供单一入口以查找相关数据类型的链接。关于数据下载方式、访问权限、所需工具或分析流程等具体操作信息，源站未提供。

【质量与限制】

该条目为 BioProject 登记记录，其功能是汇集与单一计划相关的数据链接，而非直接提供测序数据或分析结论。因此，对该数据集质量的评估需依赖其链接指向的具体数据资源，而相关质量指标、数据完整性、测序质量参数及使用限制等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，项目编号为 PRJNA1455685。关于该数据的引用格式、许可条款、使用条件及再分发要求等信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1455685

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1455685

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对hFOB 1.19人成骨细胞系（ATCC CRL-11372）进行了全基因组测序（WGS），旨在为成骨细胞生物学及骨骼疾病研究生成基因组参考资源。这些数据支持整合功能基因组学分析，以探究骨密度和骨质疏松症的遗传机制。该细胞系最初源自胎儿骨组织的人胎儿成骨细胞，随后利用温度敏感的SV40大T抗原进行永生化处理。鉴于本数据集源自市售的永生化细胞系，它并不代表人类研究群体，因此，诸如年龄分布、种族/民族、疾病状态或疾病患病率等典型人口统计学特征均不适用。…（更多内容请参见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别