BTK基因-疾病ClinGen提交

BTK基因-疾病ClinGen提交 与X连锁无丙种球蛋白血症(X-linked agammaglobulinemia)高度相关,包含文本形式的样本、标注、临床变量、组学记录或权威知识条目,可用于疾病分类、特征筛选、模型训练和公开数据集整理。

ClinGen / GenCCClinGen / GenCC
GenCC
2026-01-01 更新
浏览 29
文本分类BTKBruton-type agammaglobulinemiaX-linked agammaglobulinemiaX-linkedimmunodeficiencyClinGengene-disease relationship
ClinGen BTK Bruton-type Agammaglobulinemia

基本信息

模态
文本
数据量
1
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-01-01

资源简介

BTK基因-疾病ClinGen提交

【一句话概览】

布鲁顿型无丙种球蛋白血症(X连锁无丙种球蛋白血症)是最早被描述的原发性免疫缺陷病。BTK基因编码的酪氨酸激酶在前B细胞向成熟B细胞发育过程中起关键作用,其功能缺失导致B细胞发育受阻、抗体生成障碍,引发反复细菌感染。该基因与X连锁布鲁顿型无丙种球蛋白血症的关系已明确确立,证据涵盖病例数据、家系分离数据及实验数据,涉及23名先证者的23个独特变异,并在8名额外家庭成员中与疾病共分离(来源 thegencc.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《BTK | Bruton-type agammaglobulinemia | X-linked》。

【数据内容】

源站原始描述:Bruton-type agammaglobulinemia, or X-linked agammaglobulinemia (XLA) was the first immunodeficiency to be described (Burton,1952). The relationship of BTK to XLA was first reported in 1993 (PMIDs: 8425221, 8380905). Btk is a tyrosine kinase, which is critical in the maturation of Pre-B cells to mature B cells. The absence of functional Btk leads to failure of B-cell development that incapacitates antibody production in XLA patients leading to recurrent bacterial infections (reviewed in PMID: 269…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Bruton型无丙种球蛋白血症,或称X连锁无丙种球蛋白血症(XLA),是最早被描述的原发性免疫缺陷病(Burton,1952年)。BTK与XLA之间的关系于1993年首次报道(PMIDs: 8425221, 8380905)。Btk是一种酪氨酸激酶,在前B细胞向成熟B细胞成熟过程中起关键作用。功能性Btk的缺失导致B细胞发育失败,使XLA患者无法产生抗体,从而导致反复细菌感染(综述于PMID: 26909497)。人类中已报道超过900种独特变异(BTKbase; PMID: 16969761),包括错义、无义、移码、剪接、小插入缺失以及大片段插入或缺失。支持该基因-疾病关系的证据包括病例级数据、共分离数据和实验数据。来自4篇文献中23例先证者的23种独特变异经过审编(PMIDs: 8380905, 17765309, 7880320, 8162056)。该基因的变异在另外8名家庭成员中与疾病共分离(PMIDs: 17765309, 8162056)。文献中还有更多证据,但遗传证据和实验证据的评分已达到上限。在实验方面,该基因-疾病关系得到以下证据支持:其在B细胞发育中作为酪氨酸激酶的作用(PMID: 11606584)以及在相关细胞和组织中的表达(PMID: 8380905),两者在患者细胞中均发生改变(PMID: 8425221)。进一步支持来自嵌合小鼠(PMID: 7552995)、xid小鼠模型(PMID: 8332900)和敲除小鼠模型(PMID: 7552994),这些模型均重现了XLA的特征。总之,BTK与X连锁Bruton型无丙种球蛋白血症具有确定性关联。这一点已在研究和临床诊断环境中反复得到证实,并随时间推移得到确认。值得注意的是,该基因还与孤立性生长激素缺乏症III型(MONDO:0010615)有关。鉴于缺乏已知的重叠分子机制且表型不同,该关联已单独…

【主题与分类】

主题标签:BTK、Bruton-type agammaglobulinemia、X-linked agammaglobulinemia、X-linked、immunodeficiency、ClinGen、gene-disease relationship。

【适用方向】

文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。

【获取与许可】

源站页面:https://thegencc.org/submissions/SGC-104711.2

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源站:https://thegencc.org/submissions/SGC-104711.2

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

BTK基因-疾病ClinGen提交 是与X连锁无丙种球蛋白血症相关的公开文本数据资源,提供疾病样本、标注、变异、表达谱或标准化知识,主要用于分类和医学数据整理。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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