FHL5患者及匹配对照PBMC的RNAseq数据

该数据集来自EBI Expression Atlas的差异表达实验,包含三名家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症5型(FHL5)患者及三名年龄性别匹配对照的外周血单个核细胞(PBMC)RNAseq数据,物种为Homo sapiens

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浏览 3
基因组分类Differential
E-MTAB-8875: RNAseq on PBMC of three patients with Familial Hemophagocytic Lymphohistiocytosis Type 5 (FHL5) and three age and sex-matched controls

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

FHL5患者及匹配对照PBMC的RNAseq数据

E-MTAB-8875 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens。该实验对三名家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症5型(FHL5)患者以及三名年龄和性别匹配的对照个体的外周血单个核细胞(PBMC)进行了 RNAseq 检测。数据集归属于免疫系统疾病 / 原发性免疫缺陷分类,主题标签为 Differential,可用于比较患者组与匹配对照组在 PBMC 转录组层面的差异表达情况。

【数据集背景】

家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症5型(FHL5)属于原发性免疫缺陷相关疾病范畴。该数据集以差异表达分析为核心目的,围绕 FHL5 患者与年龄、性别匹配对照之间的 PBMC 转录组比较而组织,属于 EBI Expression Atlas 中的 Differential 类实验。源站未提供该数据集产生的具体研究背景、立项动机或更详细的疾病机制说明。

【数据内容】

数据集包含三名 FHL5 患者和三名年龄与性别匹配的对照个体的 PBMC RNAseq 数据,物种为 Homo sapiens。实验类型为 RNAseq,样本材料为外周血单个核细胞。数据集的主题标签为 Differential,表明其内容围绕差异表达分析展开。源站未提供测序平台、读长、样本处理流程、基因表达定量结果或差异基因列表等更细粒度的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,是 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录,实验编号为 E-MTAB-8875。样本来自三名 FHL5 患者及三名年龄和性别匹配的对照个体,采集材料为 PBMC。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息或具体实验操作细节。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病与原发性免疫缺陷方向的研究,尤其是围绕 FHL5 患者 PBMC 转录组与匹配对照之间差异表达的比较分析。由于实验设计包含年龄和性别匹配的对照,可用于控制这些混杂因素后的组间表达差异探索。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的使用说明。

【使用方法】

该数据集为 EBI Expression Atlas 中的差异表达实验记录,可通过源站实验编号 E-MTAB-8875 进行访问与检索。源站未提供具体的数据下载格式、分析流程、软件工具或使用步骤说明。

【质量与限制】

该数据集的样本规模为三名患者与三名匹配对照,样本量较小。源站未提供关于数据质量评估、批次效应、技术重复或验证实验的信息。使用时应结合源站记录了解其具体实验条件与适用范围。源站未提供其他质量与限制相关说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8875

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表达图谱实验(差异分析)。物种:智人。对三名家族性噬血细胞性淋巴组织细胞增生症5型(FHL5)患者及三名年龄和性别匹配的对照者的外周血单核细胞(PBMC)进行RNAseq。

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