通过免疫细胞多组学分析理解花生口服免疫治疗反应的变异性

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦花生口服免疫治疗反应的变异性。研究对 38 名花生过敏儿童在口服免疫治疗前后分离的花生刺激与未刺激免疫细胞,分析了免疫球蛋白、细胞因子、转录组和 DNA 甲基化组图谱,识别出 184 个差异表达基因和 1001 个差异甲基化基因,并突出肠道驻留

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基因组分类PBMCsDNA methylationEpigenomicsFood allergiesPeanutTranscriptome analysisoral immunotherapyBiomarkers
Understanding the variability of the peanut-oral immunotherapy response through multi-omics profiling of immune cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

通过免疫细胞多组学分析理解花生口服免疫治疗反应的变异性

Understanding the variability of the peanut-oral immunotherapy response through multi-omics profiling of immune cells

该数据集来自 search.dataone.org,聚焦花生口服免疫治疗反应的变异性。研究对 38 名花生过敏儿童在口服免疫治疗前后分离的花生刺激与未刺激免疫细胞,分析了免疫球蛋白、细胞因子、转录组和 DNA 甲基化组图谱,识别出 184 个差异表达基因和 1001 个差异甲基化基因,并突出肠道驻留的 ILC3 与 CD8 相关细胞。数据可用于探索治疗应答强弱的分子标志物、免疫细胞多组学特征及潜在生物标志物(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:口服免疫治疗是一种有前景的花生过敏治疗方法,可使大多数患者产生脱敏。然而,15-30% 的患者无应答,且治疗仍存在显著的过敏反应风险。目的:本研究旨在通过研究免疫细胞中全面的组学图谱,识别强应答者与弱应答者之间的分子差异。方法:我们分析了从 38 名花生过敏儿童在口服免疫治疗前后分离的花生刺激和未刺激免疫细胞中的免疫球蛋白、细胞因子、转录组和 DNA 甲基化组图谱。结果:我们的研究识别出 184 个与口服免疫治疗反应强度相关的差异表达基因和 1001 个差异甲基化基因。转录组和甲基化组分析突出了肠道驻留的固有(ILC3)和适应性(CD8Î

【主题与分类】

主题标签:PBMCs、DNA methylation、Epigenomics、Food allergies、Peanut、Transcriptome analysis、oral immunotherapy、Biomarkers。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A01da1545406bc4bef7f68d598ea61bfecd34816321d9eda3e1b3ca202c09dbe6

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:口服免疫治疗是一种有前景的花生过敏治疗方法,可使大多数患者产生脱敏。然而,15-30%的患者无应答,且治疗仍存在显著的过敏反应风险。目的:本研究旨在通过研究免疫细胞中全面的组学图谱,识别强应答者与弱应答者之间的分子差异。方法:我们分析了来自38名花生过敏儿童在口服免疫治疗前后分离的花生刺激和未刺激免疫细胞中的免疫球蛋白、细胞因子、转录组和DNA甲基化组图谱。结果:我们的研究识别了184个差异表达基因和1001个差异甲基化基因与口服免疫治疗应答强度相关。转录组和甲基化组图谱分析突出显示了肠道驻留的固有免疫细胞(ILC3)和适应性免疫细胞(CD8+ T细胞的CD8αα亚群)是重要参与者。

功能富集分析补充…, , , # 通过免疫细胞的多组学分析理解花生口服免疫治疗反应的变异性 ## 概述 本数据集伴随Arnau-Soler等人的研究论文,题为“通过免疫细胞的多组学分析理解花生口服免疫治疗反应的变异性”。 ## 内容 数据集包括以下补充表格: 表E1. 所有OIT样本(OIT前后)中的差异表达基因(DEGs) 表E2. OIT前检测到的差异表达基因(DGEs) 表E4. 从所有OIT样本(OIT前后)中检测到的与花生OIT反应相关的差异甲基化探针(DMPs) 表E6. OIT前检测到的与花生OIT反应相关的差异甲基化探针(DMPs) ## 引用本数据集 使用本数据集时,请引用原始研究论文: Arnau-Soler等人,“通过免疫细胞的多组学分析理解花生口服免疫治疗反应的变异性”

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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