花生口服免疫治疗反应变异性多组学免疫细胞数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.hqbzkh1pq

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 584.1 MB。

数据说明

背景：口服免疫治疗是一种有前景的花生过敏治疗方法，可使大多数患者产生脱敏。然而，15-30%的患者无应答，且治疗仍存在显著的过敏性休克风险。目的：本研究旨在通过研究免疫细胞中全面的组学图谱，识别强应答者与弱应答者之间的分子差异。方法：我们分析了从38名花生过敏儿童在口服免疫治疗前后分离的花生刺激和未刺激免疫细胞中的免疫球蛋白、细胞因子、转录组和DNA甲基化组图谱。结果：我们的研究识别出184个与口服免疫治疗应答强度相关的差异表达基因和1001个差异甲基化基因。转录组和甲基化组分析突出表明，肠道驻留的固有免疫细胞（ILC3）和适应性免疫细胞（CD8+ T细胞的CD8αα亚群）是重要参与者。功能富集分析还指出外泌体和gd T细胞在促进花生脱敏中的作用。

总体而言，我们的研究结果强调了胃肠道内调节过程在口服免疫治疗反应性中的关键作用。此外，我们证实治疗前较低的细胞因子产生（IL-4、IL-5）和花生特异性血清IgE与治疗成功相关。结论：我们的多组学方法强调了胃肠道免疫机制在花生口服免疫治疗反应差异中的重要性，并为改进治疗策略提供了潜在的生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。