花生口服免疫治疗期间胃肠道gd T细胞上调T细胞转录本与信号通路

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源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aaf81ac632d4666c659ad8b7190de3818a0524d93e53baebf0e14bcd767ab59db

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数据说明

口服免疫治疗（OIT）已成功使患者对致敏食物过敏原产生脱敏，尽管识别导致脱敏的组织驻留T细胞亚群及其同源通路一直具有挑战性。T细胞是黏膜上皮内淋巴细胞（IELs）的主要T细胞亚群，在组织稳态和修复中发挥重要作用。小鼠模型研究表明，γδ T细胞在食物过敏（FA）中具有调节作用。此外，对接受花生OIT治疗24周的患者外周γδ T细胞的分析显示，其表达谱发生动态变化，提示其参与免疫稳态相关通路。据我们所知，尚未有研究探讨FA患者在接受免疫治疗期间肠道黏膜中γδ T细胞的作用。为此，我们研究了花生OIT期间胃肠道（GI）道中的γδ T细胞是否受到调控。

我们假设，FA患者胃肠道驻留的gd T细胞在花生口服免疫治疗过程中会增加……，# 花生口服免疫治疗期间胃肠道gd T细胞显示T细胞转录本和信号通路上调 https://doi.org/10.5061/dryad.crjdfn35n ## 数据和文件结构说明 补充文件1：在分选的gdT细胞RNAseq数据集中预测的差异表达基因。每个工作表包含通过比较两个时间点的RNAseq数据集预测的DE基因。补充文件2：使用pathfindR从gdT细胞RNAseq数据集中的差异表达基因富集的通路。补充文件3：在Bulk RNAseq数据集中预测的差异表达基因。每个工作表包含通过比较两个时间点的RNAseq数据集预测的DE基因。补充图S1：(A) KEGG hsa04330 Notch信号通路，(B) KEGG hsa04540 间隙连接通路，© KEGG hsa04662 B细胞受体信号通路，(D) KEGG hsa04350 TGF-b通路。被鉴定为差异表达的转录本在

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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