Fidaxomicin 肠道纤维化研究数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A4a2cd113d4aeead214f910d7b1f6d0f8173010a4996ff368f259a69389c93ad8

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这包括一个包含3名CDS患者的10X Genomics Visium空间RNA测序数据集，一个CD-HIFs的全转录组RNA测序数据集，以及一个患者RayBiotech血清蛋白质组学数据集。10X Genomics Visium空间RNA测序由UCLA TPCL和TCGB完成。回肠组织取自UCLA病理学部门。全转录组RNA测序由UCLA TCGB完成。CD-HIF RNA样本来自Koon博士的实验室。血清蛋白质组学由RayBiotech完成。血清取自UCLA病理学部门。，# 肠道纤维化的非达霉素研究 数据集DOI：10.5061/dryad.ncjsxkt6q ## 数据和文件结构描述 血清蛋白质组学文件为CSV格式。A列为蛋白质名称。B-H列为各疾病组的百分比读数，包括健康、狭窄型CD（CDS）、非狭窄型CD（CDNS）、溃疡性结肠炎（UC）、艰难梭菌感染（CDI）、前驱糖尿病（PD）和2型糖尿病（T2DM）。I-J列为B-H列读数的平均值和标准差。K-P列为各疾病组的Z分数。Q-S列为每种蛋白质的基因名称、Uniprot和GeneIDs。

T列是对每种蛋白质的描述。## Zenodo内容 如果数据来源于商业来源，则需要正确引用。请咨询相关公司以获取指南。Zenodo上存有两个Zip文件夹。Zip文件遵循CC-BY许可协议。请解压Zip文件夹以获取RNA样本的其他文件……我们不提供个人身份信息。所有样本均已编码。由于我们没有患者的任何信息，因此无法获得参与者的明确同意。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。