适应致病菌感染的果蝇种群生活史权衡与抗逆性数据集

实验通过定向选择获得感染后存活率显著提高的种群,并比较其与祖先对照种群在幼虫发育时间、羽化体重等生活史性状上的差异,用于探讨免疫防御增强的代价与生活史权衡

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其他预测Post-infection survivallife history trade-offsEnterococcus faecalisDrosophila melanogasterExperimental EvolutionStress Resistance
Life-history trade-offs and stress resistance in Drosophila melanogaster populations adapted to pathogenic bacterial infection

基本信息

模态
其他
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

适应致病菌感染的果蝇种群生活史权衡与抗逆性数据集

Life-history trade-offs and stress resistance in Drosophila melanogaster populations adapted to pathogenic bacterial infection

该数据集来自 search.dataone.org,围绕果蝇(Drosophila melanogaster)对致病菌 Enterococcus faecalis 感染的适应性进化研究。实验通过定向选择获得感染后存活率显著提高的种群,并比较其与祖先对照种群在幼虫发育时间、羽化体重等生活史性状上的差异,用于探讨免疫防御增强的代价与生活史权衡。数据可支持免疫进化、宿主-病原互作及抗逆性相关分析(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):免疫防御增强的进化往往受到代价的限制:其他性状(即生活史性状)的相关变化会降低宿主生物的适合度。实验进化研究有助于理解免疫功能的进化以及其他性状的相关变化。我们通过实验进化了多个重复的 Drosophila melanogaster 种群,使其更好地在感染挑战中存活,所用病原为昆虫病原细菌 Enterococcus faecalis。在 35 代定向选择内,与祖先配对的对照组相比,选择种群在感染后存活率上表现出显著提高。我们随后测量了这些种群的各种生活史性状。结果表明,选择种群在幼虫发育时间和羽化时体重方面与对照种群没有差异。在……情况下也未观察到差异。

【主题与分类】

主题标签:Post-infection survival、life history trade-offs、Enterococcus faecalis、Drosophila melanogaster、Experimental Evolution、Stress Resistance。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Afa9fee7b14b46a0ee2658b202a3bc809aa6e0fb12c4c7595d96d78855fb3cfcc

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Afa9fee7b14b46a0ee2658b202a3bc809aa6e0fb12c4c7595d96d78855fb3cfcc

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

免疫防御增强的演化往往受到成本的限制:即其他性状(即生活史性状)的相关变化,这些变化否则会降低宿主生物的适合度。实验演化研究有助于理解免疫功能的演化以及其他性状的相关变化。我们通过实验演化复制了黑腹果蝇种群,使其更好地在昆虫病原细菌粪肠球菌的感染挑战中存活。在35个世代的方向性选择内,与祖先配对的对照组相比,被选择的种群在感染后存活率上表现出显著增加。我们接下来测量了这些种群的各种生活史性状。我们的结果表明,被选择的种群在幼虫发育时间和羽化时体重方面与对照种群没有差异。

在感染急性期后,无论是果蝇被置于……条件下,还是在繁殖力和寿命方面,均未观察到差异。研究测定了经选择以提高对昆虫病原性革兰氏阳性菌——粪肠球菌系统性感染后存活率的黑腹果蝇的生命史特征及对生物和非生物胁迫因子的抗性。这些种群被命名为EPN种群。1. EPN种群:历史与维持方案EPN种群源自祖先蓝岭基线(BRB)种群(Singh et al., 2021)。BRB种群由4个重复的远交种群组成,最初由Daniel Promislow教授实验室将野生捕获果蝇建立的同雌系杂交而成,这些果蝇来自美国蓝岭(Singh et al., 2015)。这些种群以14天离散世代周期维持,每代普查规模约为2800只成虫。这些种群维持在标准实验室条件下(12:12光暗周期,25°C,60%相对湿度)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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