高效调节剂治疗对囊性纤维化微生物组的影响

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源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05982795

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数据说明

疾病：囊性纤维化。本研究旨在表征囊性纤维化跨膜传导调节因子调节剂治疗对成人囊性纤维化患者鼻窦微生物群落及炎症特征的影响。参与者将被要求在两年的时间内每6个月完成以下研究活动，共计5次研究访视（第0个月、第6个月、第12个月、第18个月、第24个月）。将从中鼻道获取黏液样本，并在4ºC下保存直至培养分析。将进行半定量细菌培养。细菌群落组成将通过16S rRNA可变区（V4）扩增子测序和qPCR进行定量。数据预处理和分类学归属将使用QIIME 2（v 2023.2）和SILVA 138.1 rRNA数据库进行。丰度数据将在R（v 4.3.0）中使用decontam、phyloseq和vegan软件包进一步处理。将分析来自中鼻道和嗅裂的样本，以研究囊性纤维化患者的炎症特征。

两个样本将在4°C、10,000 rpm条件下离心10分钟，以从材料中提取全部样本。样本将通过移液管转移至冷冻管中，在液氮中速冻，并储存于-80°C环境中，直至实验室检测时。本研究将通过细胞因子芯片评估免疫状态的变化。为评估先天免疫反应，将采用Bioplex Pro人类炎症检测试剂盒检测37种人类细胞因子（BD Biosciences）。本研究还将探究鼻腔微生物组和炎症谱的变化是否与囊性纤维化特异性生活质量（QOL）及嗅觉结局的变化相关。参与者将被要求使用Sniffin’ Sticks扩展测试套件（MediSense，NL）和/或宾夕法尼亚大学嗅觉识别测试（UPSIT）完成嗅觉功能测试。此外，参与者将被要求完成以下四项调查 t

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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