公猪精液组分驱动的猪子宫基因表达与组织学变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298329

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数据说明

精浆中含有能够调节子宫环境的生物活性成分。尽管公猪射精液是分馏的，各部分的组成不同，但这些馏分对雌性生殖道的累积效应仍知之甚少。本研究评估了在人工授精（AI）后，逐步纳入射精馏分如何影响子宫基因表达、细胞增殖和免疫反应。精液剂量使用三种组合制备：FR1（富含精子的馏分）、FR2（FR1 + 中间馏分）和FR3（FR2 + 精子后馏分）。每个剂量用于母猪的宫内人工授精（每组n=5），并设有未授精的对照组（n=5）。在发情开始后六天收集子宫组织（U）进行转录组学和组织学分析。RNA测序分析鉴定出，相对于对照组，U-FR2组中差异表达基因（DEGs；FDR<0.05且|FC|≥1）数量最多（n=602），其次是U-FR3（n=465）和U-FR1（n=414）。大多数DEGs在授精母猪中下调，包括免疫相关基因如VNN2。

基因本体分析显示，各组间存在保守的生物学过程，包括代谢、免疫调节和上皮重塑。组织学评估显示，与对照组相比，所有授精组的Ki-67阳性率降低，CD3+ T细胞浸润减少（p<0.05）。值得注意的是，U-FR2和U-FR3处理母猪的子宫显示出向分泌表型更快的转变（腺体组织百分比；p<0.05）。这些发现表明，加入不同的精液组分触发了不同的子宫转录组学和组织学反应，突出了精浆成分对子宫环境的作用，并提示组分特异性精浆成分可能影响早期妊娠结局。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。