数据来源:打开文件抽屉:壶菌感染实验的意外发现
源站描述指出,感染实验虽旨在降低复杂性,但疾病结局仍受宿主、病原与环境因素间复杂互作影响,隐蔽变异会降低实验可重复性,而意外结果常被归入“文件抽屉”而丢失潜在洞见

基本信息
资源简介
数据来源:打开文件抽屉:壶菌感染实验的意外发现
Data from: Opening the file drawer: Unexpected insights from a chytrid infection experiment
该数据集来自一项感染实验研究,关注两种易感性不同但亲缘相近的蛙类(American Bullfrog Rana catesbeiana 与 Mountain yellow-legged frog Rana muscosa)对两栖类致死性壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)的响应。源站描述指出,感染实验虽旨在降低复杂性,但疾病结局仍受宿主、病原与环境因素间复杂互作影响,隐蔽变异会降低实验可重复性,而意外结果常被归入“文件抽屉”而丢失潜在洞见。该数据可用于研究宿主-病原互作、疾病动态与实验可重复性等问题(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 。
【数据集背景】
源站首次发布:2019。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):感染实验对于理解野生动物疾病动态至关重要。尽管感染实验通常旨在降低复杂性,但疾病结局仍源于宿主、病原体和环境因素之间的复杂相互作用。各因素间的隐蔽变异可能导致感染实验在研究组内部及研究组之间可重复性下降,并阻碍研究进展。此外,结果出乎意料的研究往往被归入“文件抽屉”,这些实验结果可能带来的潜在洞见也随之丢失。在此,我们报告了一项感染实验的意外结果,该实验研究两种易感性不同但亲缘相近的蛙类(American Bullfrog Rana catesbeiana 和 Mountain yellow-legged frog Rana muscosa)对两栖类致死性壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)的响应。尽管已有充分记录
【主题与分类】
主题标签:infection experiment、Chytrid、Batrachochytrium dendrobatidis。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.f127gp0
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5061/dryad.f127gp0
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 416.9 KB。
数据说明
感染实验对于理解野生动物疾病动态至关重要。尽管感染实验通常旨在降低复杂性,但疾病结局仍源于宿主、病原体和环境因素之间复杂的相互作用。各因素间的隐蔽变异可能导致感染实验在研究组内部及研究组之间可重复性降低,并阻碍研究进展。此外,结果出乎意料的研究往往被归入“文件抽屉”,而这些实验结果可能带来的潜在洞见也随之丢失。在此,我们报告了一项感染实验中出乎意料的结果,该实验研究两种易感性不同但亲缘关系相近的蛙类(美洲牛蛙 Rana catesbeiana 和山黄腿蛙 Rana muscosa)对两栖类致死性壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis,Bd)的响应。尽管两种蛙之间的易感性差异已有充分文献记载,但我们未发现抗体介导免疫反应的证据,也未发现任一物种出现与Bd相关的死亡。此外,在研究期间,假接种的 R. catesbeiana 对照组意外变为Bd阳性。
我们采用定制基因分型检测方法证明,异常感染的牛蛙携带的Bd基因型与接种基因型不同。因此,所获取的牛蛙个体携带低强度感染,qPCR无法检测到。在接种Bd的牛蛙处理组中,接种基因型似乎竞争性抑制了隐性感染。因此,我们的结果为了解Bd共感染动态提供了见解,随着不同病原体株在全球范围内传播,这一现象日益具有相关性。我们的实验凸显了意外的实验结局如何既能作为警示,也能成为探索未解研究问题的机会。我们以本研究结果作为案例,强调感染实验中异常结果的常见来源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




