濒危两栖动物宿主皮肤细菌多样性降低与病原感染强度升高相关数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.8b83gn8

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 7.53 GB。

数据说明

真菌病原体蛙壶菌(Bd)感染两栖动物的皮肤，并在全球范围内导致两栖动物严重减少和灭绝。本研究采用依赖培养和不依赖培养的方法，探讨了Bd与濒危的内华达山脉黄腿蛙(Rana sierrae)皮肤细菌微生物组之间的相互作用。样本采集自两个R. sierrae种群，这些种群过去可能经历过Bd流行病，但目前在地方性流行状态下仍与Bd共存，我们检验了这样一个假说：此类“持续存在”的种群得益于互利共生的皮肤微生物。我们的16S rRNA宏条形码数据显示，与感染水平较低的幼蛙和成蛙相比，高感染幼蛙的皮肤微生物组以物种丰富度和均匀度显著降低以及个体间变异显著较低为特征。高感染蛙皮肤微生物组中超过90%的DNA序列来源于单一目——伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales)的细菌，而在感染水平较低的蛙中这一比例仅为54%。

在依赖培养的Bd抑制试验中，我们评估的所有细菌代谢产物均抑制了Bd的生长。这些结果共同揭示了Bd感染对宿主皮肤微生物群落结构和动态的破坏性影响，并为开发抗Bd益生菌疗法提供了可能的途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。