脊索瘤公共转录组与蛋白质组跨队列证据层整合数据

该数据集是对八个公共脊索瘤转录组与蛋白质组数据集进行回顾性、探索性再分析所得的版本化衍生数据。记录包含分析就绪矩阵、主图精确数值输入、全精度非补充结果、校验和及溯源信息,分析代码以冻结的 GitHub commit 引用而不重复

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基因组预测chordomaTBXTCDK4/6interferontumor microenvironmentpublic data reanalysisgene-set scoringtranscriptomicsproteomics
Data for: Cross-Cohort Evidence-Layer Integration of Public Transcriptomic and Proteomic Data Prioritizes Immune/Interferon and TBXT-Linked Programs in Chordoma

基本信息

模态
基因组
大小
0.028238453 GB
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-11
版本
0.2.1

资源简介

脊索瘤公共转录组与蛋白质组跨队列证据层整合数据

该数据集是对八个公共脊索瘤转录组与蛋白质组数据集进行回顾性、探索性再分析所得的版本化衍生数据。记录包含分析就绪矩阵、主图精确数值输入、全精度非补充结果、校验和及溯源信息,分析代码以冻结的 GitHub commit 引用而不重复。格式化补充表、图、方法及数据集识别与角色分配流程仍见期刊补充材料。未产生新原始数据,也不含受控访问或可识别患者数据。可用于跨队列证据层整合、基因集评分及免疫/干扰素与 TBXT 相关程序优先排序等分析(来源 doi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):支持对八个公共脊索瘤转录组与蛋白质组数据集进行回顾性、探索性再分析的版本化衍生数据存档。该记录包含分析就绪矩阵、主图的精确数值输入、全精度非补充结果、校验和及溯源信息。分析代码未重复,并以冻结的 GitHub commit 引用。格式化的补充表、图、方法以及数据集识别与角色分配流程仍保留在期刊补充材料中。未产生新的原始数据,也不包含受控访问或可识别患者身份的数据。

【主题与分类】

主题标签:chordoma、TBXT、CDK4/6、interferon、tumor microenvironment、public data reanalysis、gene-set scoring、transcriptomics、proteomics。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://doi.org/10.5281/zenodo.22865078

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22865078

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 28.2 MB。

数据说明

支持对八个公开脊索瘤转录组和蛋白质组数据集进行回顾性、探索性再分析的版本化衍生数据存储。该记录包含可直接用于分析的矩阵、主图的精确数值输入、全精度非补充结果、校验和及来源信息。分析代码未重复存储,而是以冻结的GitHub提交形式引用。格式化的补充表格、图表、方法以及数据集识别与角色分配流程图仍保留在期刊补充材料中。未生成新的原始数据,也不包含受控访问或可识别患者身份的数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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