CeDNN 乳糜泻数据集
荷兰北部乳糜泻(Celiac Disease Northern Netherlands, CeDNN)正在采集乳糜泻患者、亲属、伴侣及肠易激综合征(IBS)患者的(生物)材料

基本信息
资源简介
CeDNN 乳糜泻数据集
CeDNN(Celiac Disease Northern Netherlands)是荷兰北部地区围绕乳糜泻建立的生物材料与多组学数据资源,由格罗宁根大学(University of Groningen)于2015年发布,以CeDNN名义对外呈现。该数据集在本站归入免疫系统疾病下的“其他”类别,来源指向doi.org。其核心工作是采集乳糜泻患者、患者亲属、伴侣以及肠易激综合征(IBS)患者的(生物)材料,并在此基础上对免疫细胞与微生物组进行系统刻画,以期理解乳糜泻风险基因、微生物组与环境因素如何共同参与疾病的发生。数据集主题标签为FOS: Medical and health sciences,许可状态尚未设定。
【数据集背景】
乳糜泻是一种与遗传易感性和环境因素密切相关的免疫相关疾病,其病因学机制涉及风险基因、肠道微生物组以及环境暴露之间的复杂交互。CeDNN的建立正是为了更深入地理解这些因素如何共同促成疾病。该资源由格罗宁根大学相关团队以CeDNN名义于2015年发布,立足荷兰北部地区,面向乳糜泻患者及其亲属、伴侣以及IBS患者开展材料收集与研究。其研究思路强调“整体性”方法:不局限于单一指标,而是把免疫细胞行为与微生物组状态放在个体遗传背景之下加以考察,从而为揭示乳糜泻的发病机制提供数据基础。
【数据内容】
该数据集的内容围绕多层次的生物学信息展开。按照源站描述,研究将对来自患者与对照的不同免疫细胞进行profiling(谱系刻画),并借助“组学”技术获取涵盖全部转录本、细胞因子谱、蛋白质、代谢物等在内的完整信息集合,同时结合每个个体的遗传谱背景。也就是说,数据内容既包括免疫细胞层面的特征,也包括微生物组方面的信息,还包括转录、细胞因子、蛋白与代谢等多个组学层面的读数。这些不同层面的数据集将被分析与整合,用于形成对乳糜泻潜在机制的认识。除上述组学与免疫、微生物组内容外,源站未提供更细的变量清单、样本数量或具体检测平台说明。
【采集与来源】
采集对象包括乳糜泻患者、患者的亲属、伴侣以及肠易激综合征(IBS)患者。采集的材料为(生物)材料,用于后续的免疫细胞与微生物组研究。来源机构为格罗宁根大学,数据集以CeDNN名义发布,地域背景为荷兰北部。关于具体的采样流程、样本量、随访安排、伦理审批细节以及材料类型的具体构成,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容设计,该数据集适用于研究乳糜泻病因学中遗传风险基因、微生物组与环境因素的相互作用;适用于比较乳糜泻患者与非患者在免疫细胞行为及微生物组方面的差异;也适用于在个体遗传背景之下整合转录本、细胞因子、蛋白质与代谢物等多组学信息,探索疾病相关机制。由于采集对象还包含亲属、伴侣与IBS患者,该资源也可用于涉及家庭相关个体及IBS对照的比较性研究。关于具体可支持的分析类型或已验证的应用案例,源站未提供。
【使用方法】
源站描述指出,不同免疫细胞的数据集将借助生物信息学方法进行分析与整合,以形成对乳糜泻机制的洞察。这提示使用该资源时需要面向多组学数据的整合分析思路。但关于访问途径、下载方式、数据格式、预处理步骤、分析流程或工具要求等具体使用说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的许可状态尚未设定,使用前需注意授权条件不明这一限制。源站描述在末尾处中断,未给出完整的预期成果陈述。关于样本规模、数据完整性、批次效应、质量控制指标以及已知偏差等信息,源站未提供。因此,在缺乏这些说明的情况下,对该资源的代表性或适用范围不宜作进一步推断。
【引用与许可】
该数据集以CeDNN名义发布,发布机构为格罗宁根大学,发布年份为2015年,来源站为doi.org。许可信息未设定(Not set),引用时需注意这一状态。关于具体的引用格式、作者列表细节或数据使用协议,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.34760/6a16c5c5dd5bd
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
荷兰北部乳糜泻研究项目(Celiac Disease Northern Netherlands,CeDNN)正在收集乳糜泻患者、亲属、伴侣及肠易激综合征(IBS)患者的(生物)材料。目的是更好地理解乳糜泻风险基因、微生物组和环境因素如何参与疾病病因学。为实现这一目标,将采用整体性研究方法,利用“组学”技术(即全部转录本、细胞因子谱、蛋白质、代谢物等的完整集合),在每位个体遗传背景的基础上,研究乳糜泻患者免疫细胞和微生物组的行为,并将其与非患者进行比较。为生成这些信息,我们将对患者和对照者的不同免疫细胞进行分析。这些数据集将通过生物信息学方法进行分析和整合,以深入揭示乳糜泻的潜在机制。希望新获得的知识有助于对乳糜泻发病风险增高的人群进行疾病预防,并为已发病患者发现新的治疗靶点。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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