DNA损伤激增揭示范可尼贫血转录重编程与造血缺陷的联系
该数据集包含与范可尼贫血相关的基因表达、DNA损伤标记和细胞分化状态等多模态数据，通过RNA测序和实验分析揭示了转录重编程过程中产生的基因毒性应激如何导致造血祖细胞分化中断和耗竭，主要用于研究DNA修复缺陷疾病中基因组稳定性与造血缺陷的分子机制，为治疗再生障碍性贫血提供新靶点。
基本信息
资源简介
DNA损伤激增揭示范可尼贫血转录重编程与造血缺陷的联系
【数据集背景】
本数据集源站标题为《A surge of DNA damage links transcriptional reprogramming and hematopoietic deficit in Fanconi anemia》。源站首次发布：2020-11-20。
【数据内容】
源站原始描述：Impaired DNA crosslink repair leads to Fanconi anemia (FA), characterized by a unique manifestation of bone marrow failure and pancytopenia among diseases caused by DNA damage response defects. As a recessive germline disorder, why the hematopoietic hierarchy is specifically affected is not fully understood. We find that reprogramming transcription during hematopoietic differentiation results in an overload of genotoxic stress, which causes aborted differentiation and depletion of FA mutant prog…
【数据结构与技术规格】
文件数 300 个，合计 427.27 MB。数据集 DOI：10.17632/sckwd9jgnc.2。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/sckwd9jgnc
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/sckwd9jgnc
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集研究范可尼贫血（FA）的发病机制，聚焦于DNA交联修复缺陷导致的造血系统异常。数据内容涵盖与FA相关的基因表达、DNA损伤、转录重编程及造血分化过程的信息，可能包括RNA测序、DNA损伤标记检测、细胞分化状态等数据。数据集通过实验分析FA突变造血祖细胞，揭示转录重编程（如氧化蛋白去甲基化产生的甲醛副产物）引发的基因毒性应激如何导致分化中断和细胞耗竭。主要研究方向为FA中基因组稳定性与造血缺陷的分子机制，为开发治疗再生障碍性贫血的新疗法提供依据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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