自身免疫性溶血性贫血（AIHA）HODxOTII小鼠模型中耐受性红细胞自身反应性CD4 T细胞的RNA测序数据
该数据集包含基于HODxOTII小鼠自身免疫性溶血性贫血模型的RNA测序数据，数据模态为基因表达谱（转录组），来源于脾脏中分选的CD4+Thy1.2+ T细胞，通过配对末端测序技术生成；主要应用于研究红细胞特异性自身反应性T细胞的耐受性转录特征，以探索自身免疫性疾病机制和年龄相关免疫失调等方向。
基本信息
资源简介
自身免疫性溶血性贫血（AIHA）HODxOTII小鼠模型中耐受性红细胞自身反应性CD4 T细胞的RNA测序数据
【一句话概览】
本研究旨在确定与红细胞（RBC）自身反应性CD4 T细胞耐受相关的转录本。研究采用自身免疫性溶血性贫血（AIHA）小鼠模型，将表达已知RBC特异性抗原的HOD小鼠与对HOD抗原中卵清蛋白表位发生反应的OTII动物杂交。取10至12周龄HODxOTII F1小鼠脾细胞，经抗体染色排除CD19阳性B细胞和Ter119阳性RBC后，分选CD4阳性Thy1.2阳性T细胞，提取总RNA并送检进行文库制备和RNA测序，每个样本运行3个泳道，采用双端读长，2x150nt（来源 datadryad.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNAseq of tolerized auroreactive RBC-specific CD4 T cells, HODxOTII murine model of autoimmune hemolytic anemia (AIHA)》。
【数据内容】
源站原始描述：We have previously identified that T cell tolerance is the stopgap to red blood cell (RBC)-specific autoimmunity. We have also shown that while tolerance is robust when mice are young, it fails upon age and leads to development of RBC autoantibodies. Herein, we set out to determine which transcripts were associated with tolerization of RBC-autoreative CD4 T cells. For these studies, we used a murine model of autoimmune hemolytic anemia (AIHA), whereby HOD mice (expressing a known RBC-specific an…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：我们先前已确定，T细胞耐受是红细胞（RBC）特异性自身免疫的权宜之计。我们还表明，虽然小鼠年轻时耐受性很强，但随着年龄增长，耐受性会失效并导致RBC自身抗体的产生。在此，我们旨在确定哪些转录本与RBC反应性CD4 T细胞的耐受化相关。为此，我们使用了自身免疫性溶血性贫血（AIHA）的小鼠模型，其中HOD小鼠（表达已知的RBC特异性抗原）与OTII动物（对HOD抗原中包含的卵清蛋白表位有反应）杂交[见PMCID PMC8634489]。为此，从10-12周龄的HODxOTII F1小鼠（每种基因型n=4）中收集脾细胞，并用针对Thy1.2、Ter119、CD19和CD4的抗体染色。从活单细胞中排除CD19+ B细胞和Ter119+ RBC细胞，并分选CD4+Thy1.2+ T细胞。使用RNeasy mini plus试剂盒（Qiagen）提取总RNA。样品被送往华盛顿大学医学院遗传学系基因组技术访问中心进行文库制备和RNAseq。每个样品在3个泳道上运行，采用双端读取，2x150nts。
【主题与分类】
主题标签：RNAseq、CD4 T cells、autoimmune hemolytic anemia、AIHA、HODxOTII、murine model、RBC-specific autoimmunity、T cell tolerance、splenocytes、C57Bl/6J。
【获取与许可】
源站页面：https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061%2Fdryad.5qfttdzdf
下载信息
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数据集获取
源站：https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061%2Fdryad.5qfttdzdf
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是基于小鼠自身免疫性溶血性贫血（AIHA）模型的RNA测序数据，旨在研究红细胞特异性自身反应性CD4 T细胞的耐受性转录组特征。数据来源于HODxOTII F1杂交小鼠（10-12周龄）脾脏中分选的CD4+Thy1.2+ T细胞，通过排除B细胞和红细胞后获取，并采用RNeasy mini plus试剂盒提取总RNA，随后在华盛顿大学医学院基因组技术访问中心进行文库构建和RNA测序（配对末端读取，2x150nt）。数据集包含4只不同基因型小鼠的样本，每个样本在3个测序通道上运行，主要应用于自身免疫性疾病机制、T细胞耐受性转录调控、以及年龄相关自身免疫发展等研究方向。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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