LinkedOmics TCGA-PCPG下载集
LinkedOmics TCGA-PCPG下载集是公开可访问数据集，包含PCPG表达、甲基化、临床和多组学下载矩阵等表格数据，围绕迷走副神经节瘤相关临床表现、影像、信号或组学信息，适合用于分类、模型训练、外部验证和疾病机制探索。
基本信息
资源简介
LinkedOmics TCGA-PCPG下载集
【一句话概览】
LinkedOmics 提供嗜铬细胞瘤与副神经节瘤（TCGA-PCPG）的多组学数据集下载，涵盖临床注释、甲基化、miRNA、突变、RPPA、RNAseq 及 SCNV 等数据类型，样本数为 179（来源 linkedomics.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Datasets for Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA-PCPG)》。
【数据内容】
源站原始描述：LinkedOmics :: Data Download LinkedOmics Analyzing multi-omics data within and across 32 cancer types Data Download Portal <- Explore LinkedOmics Datasets Cohort Overview Datasets for Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA-PCPG) OMICS Dataset Link Description Level Unit Samples Atrributes File type Clinical Download Clinical annotation Clinical Phenotype 179 9 tsi Methylation (CpG-site level, HM450K) Download Methylation data of tumor samples at CpG-site level (Beta values, Illumina HM450K pla…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：LinkedOmics :: 数据下载 LinkedOmics 分析32种癌症类型内部及跨癌种的多组学数据 数据下载门户 <- 探索LinkedOmics数据集 队列概览 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（TCGA-PCPG）数据集 组学 数据集 链接 描述 级别 单位 样本数 属性 文件类型 临床 下载 临床注释 临床 表型 179 9 tsi 甲基化（CpG位点水平，HM450K） 下载 肿瘤样本在CpG位点水平的甲基化数据（Beta值，Illumina HM450K平台） CpG Beta值（Val-0.5） 179 336763 cct 甲基化（基因水平，HM450K） 下载 肿瘤样本在基因水平的甲基化数据（Beta值，Illumina HM450K平台） 基因 Beta值（Val-0.5） 179 20113 cct miRNA（基因水平） 下载 肿瘤样本的miRNA表达（标准化，RPM） miR基因 表达（RPM，Log2(Val+1)） 179 751 cct 突变（基因水平） 下载 基因水平的体细胞突变 SNVs 基因 突变状态（MutSig2CV） 179 43 cbt 突变（位点水平） 下载 位点水平的体细胞突变 SNVs 突变位点 突变状态（MutSig2CV） 179 4 cbt RPPA（分析物水平） 下载 反向相蛋白阵列（RPPA）表达标准化（分析物水平） 分析物 表达（信号） 79 182 cct RPPA（基因水平） 下载 反向相蛋白阵列（RPPA）表达标准化（基因水平） 基因 表达（信号） 79 151 cct RNAseq（HiSeq，基因水平） 下载 RNAseq数据标准化计数（Illumina HiSeq平台，基因水平，标准化log2 RPKM） 基因 表达（RSEM，Log2(Val+1)） 179 19696 cct SCNV（焦点水平，…
【主题与分类】
主题标签：Pheochromocytoma、Paraganglioma、TCGA-PCPG、multi-omics、methylation、miRNA、mutation、RPPA、RNAseq、SCNV。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-PCPG/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-PCPG/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
LinkedOmics TCGA-PCPG下载集包含PCPG表达、甲基化、临床和多组学下载矩阵等表格数据，可用于迷走副神经节瘤相关分类、诊断建模、分型或外部验证。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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