原发性干燥综合征患者干眼临床表现严重程度影响泪液蛋白表达
该数据集来自 plos.figshare.com，配套 PLOS ONE 2018 年论文，聚焦原发性干燥综合征（pSS）患者干眼临床表现严重程度与泪液蛋白表达之间的关联
基本信息
资源简介
原发性干燥综合征患者干眼临床表现严重程度影响泪液蛋白表达
Severity of clinical dry eye manifestations influences protein expression in tear fluid of patients with primary Sjögren’s syndrome
该数据集来自 plos.figshare.com，配套 PLOS ONE 2018 年论文，聚焦原发性干燥综合征（pSS）患者干眼临床表现严重程度与泪液蛋白表达之间的关联。研究纳入 27 例患者和 32 名健康对照，收集病史、问卷主观症状以及泪液渗透压、泪膜破裂时间（TFBUT）、Schirmer 试验等客观指标，并基于 LC-MS 泪液蛋白质组数据进行分析。数据集含 4 个补充文件，可用于探索干眼表现相关的蛋白表达变化及候选生物标志物（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Severity of clinical dry eye manifestations influences protein expression in tear fluid of patients with primary Sjögren’s syndrome》发表于 PLOS ONE（2018），DOI：10.1371/journal.pone.0205762。源站首次发布：2018-10-12。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：眼干是原发性干燥综合征（pSS）的特征性表现。这可能导致干眼病（DED），造成眼表损伤。在评估 pSS 患者时，需要额外的非侵入性诊断技术。因此，在生物体液中筛查疾病特异性生物标志物可能具有前景。我们此前已通过液相色谱-质谱联用（LC-MS）检测了 pSS 患者泪液的蛋白质组，并对 pSS 患者进行了全面的眼部评估。在本研究中，我们进一步探索了 pSS 患者干眼表现与泪液蛋白表达之间的关联。收集了 27 例患者和 32 名健康对照的病史。通过问卷记录主观主诉。客观发现包括泪液渗透压、泪膜破裂时间（TFBUT）、Schirmer 试验以及
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 3.74 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0205762。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：LIM、APEX、fluid、proteomic biomarker profiles、PRDX、ACO、CPNE、DNA、upregulated proteins、LMO。本站分类：眼病/干燥综合征。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Severity_of_clinical_dry_eye_manifestations_influences_protein_expression_in_tear_fluid_of_patients_with_primary_Sj_gren_s_syndrome/7202846
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：A. Aqrawi, Lara; Chen, Xiangjun; Jensen, Janicke Liaaen; Morthen, Mathias Kaurstad; Thiede, Bernd; Utheim, Øygunn Aass; et al. (2018). Severity of clinical dry eye manifestations influences protein expression in tear fluid of patients with primary Sjögren’s syndrome. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Severity of clinical dry eye manifestations influences protein expression in tear fluid of patients with primary Sjögren’s syndrome
- DOI：10.1371/journal.pone.0205762
- 发布日期：2018-10-12
- 文件数：4 个
- 文件总体积：3.74 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Severity_of_clinical_dry_eye_manifestations_influences_protein_expression_in_tear_fluid_of_patients_with_primary_Sj_gren_s_syndrome/7202846
命令行下载
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文件清单
pone.0205762.s001.docx（98.76 KB）pone.0205762.s002.docx（64.27 KB）pone.0205762.s003.pdf（2.55 MB）pone.0205762.s004.pdf（1.02 MB）
文件总体积 3.74 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
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files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
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# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
眼干是原发性干燥综合征(pSS)的特征性表现。这可能导致干眼病(DED)，进而造成眼表损伤。在评估pSS患者时，需要额外的无创诊断技术。因此，在生物体液中筛查疾病特异性生物标志物可能具有前景。我们此前已通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)检测了pSS患者泪液的蛋白质组，并对pSS患者进行了全面的眼部评估。在本研究中，我们进一步探讨了pSS患者干眼表现与泪液蛋白表达之间的关联。收集了27例患者和32例健康对照的病史。通过问卷记录主观症状。还记录了客观检查结果，包括泪液渗透压、泪膜破裂时间(TFBUT)、Schirmer试验以及眼表和角膜表面染色。此前已对所有受试者的泪液进行LC-MS检测，以生成蛋白质组生物标志物谱。
采用Scaffold软件分析LC-MS数据，以量化患者组与对照组之间的差异，并计算与干眼症表现相关的五种上调最显著蛋白质的平均光谱计数。通过FunRichv3富集分析，在pSS患者中识别出失调的细胞过程。先前在pSS患者中鉴定出的五种上调最显著的蛋白质依次为：DNA（脱嘌呤或脱嘧啶位点）裂解酶（APEX1）、硫氧还蛋白依赖性过氧化物还原酶（PRDX3）、copine蛋白（CPNE1）、乌头酸水合酶（ACO2）以及仅含LIM结构域蛋白7（LMO7）。与健康对照组相比，具有病理性干眼症表现的pSS患者中这些蛋白质的平均光谱计数显著增加（p<0.0001）。因此，还检测到了涉及先天性和适应性免疫的失调细胞通路。总之，我们的观察结果表明，pSS患者泪液中干眼体征的存在与上调蛋白质之间存在关联。需要进一步研究以重复所探索的概念和分析。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0205762（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Severity_of_clinical_dry_eye_manifestations_influences_protein_expression_in_tear_fluid_of_patients_with_primary_Sj_gren_s_syndrome/7202846）。
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