遗传性慢性胰腺炎—基因-疾病关联

主题标签:慢性胰腺炎、胰腺癌、基因-疾病关联、LC-MS、蛋白质组学。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖慢性胰腺炎。

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基因组预测慢性胰腺炎胰腺癌基因-疾病关联LC-MS蛋白质组学
Hereditary chronic pancreatitis — Gene-Disease Associations

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

遗传性慢性胰腺炎—基因-疾病关联

Hereditary chronic pancreatitis — Gene-Disease Associations 是一个面向肿瘤及相关疾病研究领域的公开数据集,主题聚焦于慢性胰腺炎与胰腺癌之间的基因-疾病关联。该数据集来源于 ebi.ac.uk,其源站描述指向 Sakari Joenväärä 于 2025 年发布的一项基于液相色谱-质谱联用(LC-MS)的蛋白质组学研究,数据集标题为“Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS”。从主题标签来看,该数据集涵盖慢性胰腺炎、胰腺癌、基因-疾病关联、LC-MS 以及蛋白质组学等关键词,属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖慢性胰腺炎。整体而言,该数据集为研究者提供了一个围绕慢性胰腺炎与胰腺癌比较分析的公开数据资源,适合用于探索两类胰腺疾病在蛋白质组层面的差异及其与基因-疾病关联相关的信息。

【数据集背景】

该数据集的主题背景涉及慢性胰腺炎与胰腺癌两类胰腺疾病。源站描述显示,其原始研究以“Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS”为题,表明研究工作围绕慢性胰腺炎与胰腺癌之间的比较展开,并采用 LC-MS 技术进行蛋白质组学层面的分析。数据集名称中的“Gene-Disease Associations”表明其内容与基因-疾病关联相关,而主题标签进一步将慢性胰腺炎、胰腺癌、基因-疾病关联、LC-MS 和蛋白质组学列为该数据集的核心主题。该数据集在站内分类中归入肿瘤 / 其他类别,说明其被组织在肿瘤相关数据资源的范畴之下,同时主题涵盖慢性胰腺炎这一非肿瘤性胰腺疾病,体现出两类疾病对照研究的定位。

【数据内容】

该数据集的主题涵盖慢性胰腺炎,并涉及胰腺癌、基因-疾病关联、LC-MS 与蛋白质组学等方向。从源站描述可知,其原始数据集标题为“Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS”,表明数据内容与慢性胰腺炎和胰腺癌的 LC-MS 分析相关。数据集名称中的“Gene-Disease Associations”指向基因-疾病关联这一内容维度。关于数据的具体组成、样本数量、文件格式、字段结构、基因或蛋白质条目数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述标明其作者为 Sakari Joenväärä,发布年份为 2025 年,数据集标题为“Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS”,并给出了对应的项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005144。该链接指向 PRIDE 归档项目 PXD005144。关于样本采集地点、采集时间、实验设计细节、仪器型号与具体实验流程等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与源站描述,该数据集适用于与慢性胰腺炎、胰腺癌、基因-疾病关联、LC-MS 和蛋白质组学相关的研究场景,例如围绕慢性胰腺炎与胰腺癌的比较分析、蛋白质组学层面的差异探索,以及基因-疾病关联方向的数据参考。由于站内分类将其归入肿瘤 / 其他,该数据集也可作为肿瘤领域公开数据资源用于相关主题的检索与参考。关于具体的适用分析类型、推荐研究问题或验证用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站描述中给出的项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005144 访问。关于数据下载方式、文件组织方式、预处理步骤、分析工具与使用许可条件等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源于 ebi.ac.uk,其源站描述指向 PRIDE 归档项目 PXD005144。关于数据质量评估指标、完整性、准确性、偏差来源、样本规模限制或使用中的注意事项,源站未提供。

【引用与许可】

依据源站描述,该数据集的引用信息为:Sakari Joenväärä (2025). Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005144。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005144

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sakari Joenväärä (2025). Chronic pancreatitis vs pancreatic cancer LC-MS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005144

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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