着丝粒蛋白E作为视网膜母细胞瘤新型生物标志物和潜在治疗靶点数据集

该数据集整合了来自公共数据库的多个基因表达数据集,包含视网膜母细胞瘤相关的基因表达、蛋白质相互作用、免疫细胞浸润和调控网络等多模态数据,主要用于识别视网膜母细胞瘤的核心生物标志物(如CENPE等六个枢纽基因)和潜在治疗靶点,支持癌症靶向治疗、免疫学分析和药物敏感性研究。

Sun, Xiaodong; Wu, Jiali; Zhu, Xinyue; Chen, Yuhong; Zhang, Jingfa; Shi, KeSun, Xiaodong; Wu, Jiali; Zhu, Xinyue; Chen, Yuhong; Zhang, Jingfa; Shi, Ke
Taylor & Francis Group
2024-02-16 更新
浏览 29
Retinoblastomacentromere protein E (CENPE)biomarkerGene Expression Omnibus (GEO)bioinformaticsRT-qPCRimmunoblotting
Centromere protein E as a novel biomarker and potential therapeutic target for retinoblastoma

基本信息

大小
0.002932414 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-02-16
版本
v2

资源简介

着丝粒蛋白E作为视网膜母细胞瘤新型生物标志物和潜在治疗靶点数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Centromere protein E as a novel biomarker and potential therapeutic target for retinoblastoma》。配套论文《Centromere protein E as a novel biomarker and potential therapeutic target for retinoblastoma》发表于 Bioengineered(2021),DOI:10.1080/21655979.2021.1972080。项目资助方:This work was supported by the [National Key R&D Program] under Grant [2017YFA0105301]; the [National Natural Science Foundation of China] under Grant [81730026, 81760176, and 81960158]; the [Science and Technology Commission of Shanghai Municipality] under Grant [20Z11900400]; the [Shanghai Hospital Development Center] under Grant [SHDC2020CR2040B]; the [Cultivation Program of National Natural Science Foundation for Outstanding Youth] under Grant [20202ZDB01014]; and the [Key Program of Youth Science Foundation of Jiangxi Province] under Grant [20202ACBL216009].。源站首次发布:2021-12-31。

【数据内容】

源站原始描述:Retinoblastoma is the most common intraocular malignancy during childhood. Currently, there is no effective treatment for metastatic retinoblastoma. We investigated potential biomarkers of retinoblastoma by utilizing three datasets from a public database. Functional enrichment analysis, including gene ontology, Kyoto encyclopedia of genes and genomes, gene set enrichment analysis and variation analysis, suggested that differentially expressed genes in retinoblastoma were enriched in accelerated…

【数据结构与技术规格】

文件数 5 个,合计 2.93 MB。Supplementary Figure 1 V1.tif:image/tiff,2.64 MB。Supplementary Table 1.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,62.97 KB。Supplementary Table 2.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,171.04 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.16571378.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology。主题标签:Retinoblastoma、centromere protein E (CENPE)、biomarker、Gene Expression Omnibus (GEO)、bioinformatics、RT-qPCR、immunoblotting。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Developmental Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Centromere_protein_E_as_a_novel_biomarker_and_potential_therapeutic_target_for_retinoblastoma/16571378

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Centromere protein E as a novel biomarker and potential therapeutic target for retinoblastoma. Taylor & Francis. Shi, Ke; Zhu, Xinyue; Wu, Jiali; Chen, Yuhong; Zhang, Jingfa; Sun, Xiaodong

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-02-16,引用时请注意版本时效。

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源站:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Centromere_protein_E_as_a_novel_biomarker_and_potential_therapeutic_target_for_retinoblastoma/16571378/2

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数据说明

该数据集聚焦于儿童期最常见的眼内恶性肿瘤——视网膜母细胞瘤,旨在探索其生物标志物和潜在治疗靶点。数据集整合了来自公共数据库的三个独立数据集,通过功能富集分析(如基因本体论、KEGG通路、基因集富集分析和变异分析)揭示了视网膜母细胞瘤中差异表达基因在细胞周期加速事件中的富集情况。蛋白质-蛋白质相互作用分析构建了一个包含六个核心基因(BUB1、CDK1、CENPE、KIF20A、PBK、TPX2)的网络。研究进一步分析了CENPE的调控机制(包括非编码RNA和转录因子)、免疫细胞浸润(特别是浆细胞和B细胞)与CENPE表达的关系,并进行了泛癌分析。体外实验验证了CENPE在视网膜母细胞瘤细胞中mRNA和蛋白水平上的显著上调。该数据集主要用于视网膜母细胞瘤的生物标志物发现、靶向治疗研究和癌症免疫学分析。

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