AllergenOnline过敏原数据库

AllergenOnline 是食品安全和分子过敏研究中常用的过敏原蛋白序列数据库,提供已知过敏原、FASTA检索和版本化下载,适合用于过敏原识别、交叉反应预测和蛋白序列分类。

Food Allergy Research and Resource ProgramFood Allergy Research and Resource Program
AllergenOnline
2026-01-01 更新
浏览 72
表格分类allergenallergenicityIgE bindingprotein sequencesWHO/IUIS Allergen NomenclatureCeliac Diseasefood allergybioinformatics
AllergenOnline

基本信息

模态
表格
数据量
2372
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-01-01

资源简介

AllergenOnline过敏原数据库

【一句话概览】

AllergenOnline 由内布拉斯加大学林肯分校维护,提供过敏原数据库浏览与序列搜索,并附乳糜泻相关链接。数据库按物种(学名与通用名)列出过敏原序列,标注 WHO/IUIS 命名、过敏原类型、过敏原分组、长度、登录号与 GI 号,同一过敏原可含多个异构体或部分序列。序列按来源生物分类与序列一致性聚类为组,由专家小组评估致敏性证据并列出参考文献。致敏性依据同行评议文献中的 IgE 结合或结合生物学活性、皮肤点刺试验等证据(来源 allergenonline.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《AllergenOnline》。

【数据内容】

源站原始描述:Browse the Database University of Nebraska–Lincoln Show Search Form Search Submit Close Allergen Online Open Menu Open Search Form Log In Show Menu > About Contact Browse the Database Sequence Search Version History Celiac Disease Helpful Links Allergen Database Download as PDF: AllergenOnlineV24.pdf Species Common IUIS Allergen Type Group Allergenicity Length Accession GI# 1 st Version Loading… Allergen Source: Sequences of allergens are compiled in a table under "species", shown in th…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):浏览数据库 内布拉斯加大学林肯分校 显示搜索表单 搜索 提交 关闭 过敏原在线 打开菜单 打开搜索表单 登录 显示菜单 > 关于 联系我们 浏览数据库 序列搜索 版本历史 乳糜泻 有用链接 过敏原数据库 下载为PDF:AllergenOnlineV24.pdf 物种 常见 IUIS 过敏原类型 组 过敏原性 长度 登录号 GI号 第1版 加载中…… 过敏原来源:过敏原序列汇编在“物种”下的表格中,显示在左栏(学名:属和种)。列出了来源的常用名。每个序列单独列出:并且单个过敏原可能有多个异构体或部分序列(例如 美味猕猴桃 Act d 1) WHO/IUIS过敏原命名法:(世界卫生组织/国际免疫学会联合会)名称或命名如已知则显示,缩写为IUIS。显示了过敏原类型:(例如 气传植物、食物动物、毒液或唾液) 过敏原组:组名包括属和蛋白质类型或IUIS命名。数据库中包含的蛋白质的多个异构体或近缘同源物根据来源生物体的分类学和蛋白质的序列同一性进行聚类。过敏原性证据针对一个组内的集体序列进行汇编和评估,供AllergenOnline.org专家小组审查,并展示与序列相关的参考文献。过敏原“组”链接到更多信息,包括描述用于将蛋白质分类为过敏原的信息的已发表参考文献,以及聚类到该组中的各个序列。过敏原表中的登录号和GI号链接到NCBI条目以显示完整的NCBI条目,尽管GI号已不再在NCBI中显示。出版物参考文献列在组或gid列表中。参考文献可能适用于单个序列,或组中的多个序列。它们提供了来源过敏原性的证据。 过敏原性:同行评审的出版物仅描述IgE结合(蛋白质印迹、ELISA)而无生物活性;或IgE结合加生物活性测试,通过嗜碱性粒细胞活化或IgE加皮肤点刺试验测量。 注意 基于组参考文献分类的过敏原性列的添加于2018年5月10日添加。 参考文献:组名链接

【主题与分类】

主题标签:allergen、allergenicity、IgE binding、protein sequences、WHO/IUIS Allergen Nomenclature、Celiac Disease、food allergy、bioinformatics。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.allergenonline.org/databasebrowse.shtml

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数据集获取

源站:https://www.allergenonline.org/databasebrowse.shtml

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

AllergenOnline 汇集已知和疑似过敏原蛋白序列,支持序列相似性检索和食品安全过敏原评估。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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