视网膜测序数据2
该数据集为人类胚胎发育第12周和第14周视网膜组织的单细胞测序数据,包含基因表达谱等多模态信息,通过10x Genomics和Illumina测序平台获取,主要用于研究视网膜在胚胎期的细胞类型分化、基因调控网络及发育轨迹,为视网膜发育生物学和相关疾病机制提供重要数据基础。
基本信息
资源简介
该数据集包含人类胚胎发育期第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据。数据通过获取相应阶段的视网膜组织,经木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化处理成单细胞悬液,流式分选后利用10x Genomics技术进行扩增建库,最终在Illumina平台上完成双端150bp测序。数据集主要用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的基因表达谱、细胞类型鉴定及其动态变化,为视网膜发育生物学、疾病机制探索及再生医学提供基础数据支持。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1740603279979552769
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含人类胚胎发育期第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据。数据通过获取相应阶段的视网膜组织,经木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化处理成单细胞悬液,流式分选后利用10x Genomics技术进行扩增建库,最终在Illumina平台上完成双端150bp测序。数据集主要用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的基因表达谱、细胞类型鉴定及其动态变化,为视网膜发育生物学、疾病机制探索及再生医学提供基础数据支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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