视网膜测序数据2

该数据集为人类胚胎发育第12周和第14周视网膜组织的单细胞测序数据,包含基因表达谱等多模态信息,通过10x Genomics和Illumina测序平台获取,主要用于研究视网膜在胚胎期的细胞类型分化、基因调控网络及发育轨迹,为视网膜发育生物学和相关疾病机制提供重要数据基础。

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2023-12-29 更新
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单细胞测序胚胎发育

基本信息

创建/更新时间
2023-12-29

资源简介

该数据集包含人类胚胎发育期第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据。数据通过获取相应阶段的视网膜组织,经木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化处理成单细胞悬液,流式分选后利用10x Genomics技术进行扩增建库,最终在Illumina平台上完成双端150bp测序。数据集主要用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的基因表达谱、细胞类型鉴定及其动态变化,为视网膜发育生物学、疾病机制探索及再生医学提供基础数据支持。

原始链接

https://www.braindatacenter.cn/datacenter/web/#/dataSet/details?id=1740603279979552769

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数据说明

该数据集包含人类胚胎发育期第12周和第14周的视网膜组织单细胞测序数据。数据通过获取相应阶段的视网膜组织,经木瓜蛋白酶、胶原酶IV和DNase1消化处理成单细胞悬液,流式分选后利用10x Genomics技术进行扩增建库,最终在Illumina平台上完成双端150bp测序。数据集主要用于研究胚胎发育过程中视网膜细胞的基因表达谱、细胞类型鉴定及其动态变化,为视网膜发育生物学、疾病机制探索及再生医学提供基础数据支持。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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