scRNA-seq揭示复发T-ALL免疫微环境及JUN介导的NK细胞耗竭

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256:ec3c7a540b7b73754818ede57b11985abc33172debf8eb032a49529b665dd5e2

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）研究的单细胞转录组测序数据集，通过单细胞RNA测序技术，系统分析了正常供体、初诊T-ALL患者和复发T-ALL患者的骨髓免疫微环境，识别了13个主要细胞簇，揭示了HSCs和GMPs的异常扩增、CD4+T、CD8+T和NK细胞的免疫抑制特征，特别是发现了复发T-ALL患者肿瘤微环境中NK细胞耗竭现象，并鉴定JUN为关键调控因子。数据集还包含T-ALL PDX模型小鼠在不同时间点的单细胞转录组数据（模拟初诊、缓解和复发状态），以及T-ALL NOTCH1基因突变小鼠模型中JNK-IN-8治疗组与对照组的RNA-seq数据，为研究T-ALL复发机制、免疫微环境重塑和潜在治疗靶点提供了重要资源。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))