综合视网膜底片数据集
该数据集是一个包含46,064张视网膜底片图像的多模态医学影像数据集,整合了来自十个公共数据源的图像,涵盖了多种设备、种族、年龄和视网膜病变类型,主要用于支持视网膜疾病的计算机辅助诊断和人工智能算法的研究与开发,以提升疾病筛查和管理的自动化水平。
基本信息
资源简介
综合视网膜底片数据集(IRFundusSet)是由清华大学-伯克利深圳学院与深圳眼科医院合作构建的综合性视网膜图像数据集。该数据集整合了来自十个不同公共来源的46,064张视网膜底片图像,涵盖了多种成像设备、种族背景、年龄组别以及多种视网膜病变类型。在构建过程中,研究团队对图像进行了手动审查和标注,确保了数据质量和标注一致性。该数据集主要应用于视网膜疾病的计算机辅助诊断、人工智能算法(如深度学习模型)的研发与评估,旨在提升疾病筛查、诊断和管理的自动化水平与效率。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
免登录有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务,注意,服务不针对数据相关产权,只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放千方医数集,医疗数据集部分,是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎,并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求,可以和客服联系,或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取
git clone https://github.com/bilha-analytics/IRFundusSet.git
curl -L -o repo.zip https://github.com/bilha-analytics/IRFundusSet/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip
源站 README 摘录(使用方式)
Usage
Installation
pip install irfundusset
Data Sources
Identified datasets are in the public space and, therefore, we leave it to the researcher to access and directly download the datasets.
For testing purposes, you can download CHASEDB, which is currently the smallest source in the collection (about 3 Mb). High-Resolution Fundus (HRF) is the second smallest source (about 73Mb).
Generate integrated dataset
Once downloaded, obtain the template configuration file template_set_cohorts.ini and indicate where the datasets are located.
Then initialize your IRFundusSet data object as shown below to generated the consolidated dataset and save it to your desired location.
## 数据加载示例(图像类)
```python
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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