全长人源NPC1蛋白4.4埃分辨率冷冻电镜结构数据集

该数据集包含人源NPC1蛋白全长结构的冷冻电镜解析数据,分辨率为4.4埃,数据模态包括蛋白质三维坐标、电子密度图及配体分子信息,主要用于研究NPC1蛋白在尼曼-皮克病C1型中的结构功能、疾病机制及药物靶点发现等结构生物学方向。

Protein Data Bank Japan
2024-10-16 更新
浏览 24
蛋白质结构解析尼曼-皮克病C1型
Cryo-EM Structure of the Full-Length Human NPC1 at 4.4 Ångstrom

基本信息

创建/更新时间
2024-10-16

资源简介

全长人源NPC1蛋白4.4埃分辨率冷冻电镜结构数据集

【一句话概览】

该数据集条目记录的是全长人类 NPC1 的冷冻电镜结构,分辨率标注为 4.4 埃。源站标题明确给出这一结构信息,原始描述仅标注为膜蛋白,标签同样为 MEMBRANE PROTEIN。条目未提供更多关于样本来源、实验方法或结构特征的说明,现有事实仅限于结构名称、分辨率数值以及膜蛋白这一分类(来源 RCSB PDB)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《cryo-EM structure of the full-length human NPC1 at 4.4 angstrom》。

【主题与分类】

主题标签:MEMBRANE PROTEIN。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/3JD8

规范引用:The structure of Niemann-Pick C1 protein () To Be Published

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数据集获取

源站:https://pdbj.org/mine/summary/3jd8

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了人源Niemann-Pick C1(NPC1)蛋白全长结构的冷冻电镜解析数据,分辨率为4.4埃。数据包含蛋白质的原子坐标、电子密度图以及相关的配体信息,如胆固醇、N-乙酰葡萄糖胺等分子。数据通过冷冻电镜技术采集并经过三维重构处理,来源于蛋白质数据库日本(Protein Data Bank Japan)。该数据集主要用于研究NPC1蛋白的结构与功能、其在尼曼-皮克病C1型发病机制中的作用,以及相关药物靶点的结构生物学分析。

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