重组Beta-2-糖蛋白I与推测膜插入环

该数据集提供了通过X射线衍射解析的重组Beta-2-糖蛋白I及其推测膜插入环的三维结构数据,包含蛋白质坐标及糖基化修饰细节等结构模态,主要应用于抗磷脂综合征的病理机制研究,为探索自身免疫性疾病中蛋白质结构与功能的关系提供关键实验依据。

Protein Data Bank Japan
2024-11-06 更新
浏览 34
蛋白质结构解析抗磷脂综合征研究
Recombinant Beta-2-Glycoprotein I with putative membrane insertion loop

基本信息

创建/更新时间
2024-11-06

资源简介

重组Beta-2-糖蛋白I与推测膜插入环

【一句话概览】

重组β2-糖蛋白I(Recombinant Beta-2-Glycoprotein I)是一种血浆蛋白,具有推测的膜插入环结构,参与抗体结合,并与抗磷脂综合征及血液凝固相关(来源 RCSB PDB)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Recombinant Beta-2-Glycoprotein I with putative membrane insertion loop》。

【数据内容】

源站原始描述:Plasma protein, antibody binding, antiphospholipid syndrome, BLOOD CLOTTING

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):血浆蛋白、抗体结合、抗磷脂综合征、血液凝固

【主题与分类】

主题标签:BLOOD CLOTTING。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/6XST

规范引用:Beta-2-Glycoprotein I and it''s role in APS () To Be Published

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/6xst

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含重组Beta-2-糖蛋白I(β2GPI)及其推测膜插入环的结构信息,通过X射线衍射方法在2.92 Å分辨率下解析。数据内容涵盖2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-[α-L-吡喃岩藻糖-(1-6)]2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖等糖基化修饰细节,以及Beta-2-糖蛋白I的完整结构坐标。该数据集源自日本蛋白质数据库(PDB),主要应用于抗磷脂综合征(APS)的病理机制研究,特别是探索β2GPI在自身免疫性疾病中的结构与功能关系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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