重组Beta-2-糖蛋白I与推测膜插入环

该数据集提供了通过X射线衍射解析的重组Beta-2-糖蛋白I及其推测膜插入环的三维结构数据,包含蛋白质坐标及糖基化修饰细节等结构模态,主要应用于抗磷脂综合征的病理机制研究,为探索自身免疫性疾病中蛋白质结构与功能的关系提供关键实验依据。

Protein Data Bank Japan
2024-11-06 更新
浏览 11
蛋白质结构解析抗磷脂综合征研究

基本信息

创建/更新时间
2024-11-06

资源简介

该数据集包含重组Beta-2-糖蛋白I(β2GPI)及其推测膜插入环的结构信息,通过X射线衍射方法在2.92 Å分辨率下解析。数据内容涵盖2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-[α-L-吡喃岩藻糖-(1-6)]2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖等糖基化修饰细节,以及Beta-2-糖蛋白I的完整结构坐标。该数据集源自日本蛋白质数据库(PDB),主要应用于抗磷脂综合征(APS)的病理机制研究,特别是探索β2GPI在自身免疫性疾病中的结构与功能关系。

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https://pdbj.org/mine/summary/6xst

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数据说明

该数据集包含重组Beta-2-糖蛋白I(β2GPI)及其推测膜插入环的结构信息,通过X射线衍射方法在2.92 Å分辨率下解析。数据内容涵盖2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-[α-L-吡喃岩藻糖-(1-6)]2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖等糖基化修饰细节,以及Beta-2-糖蛋白I的完整结构坐标。该数据集源自日本蛋白质数据库(PDB),主要应用于抗磷脂综合征(APS)的病理机制研究,特别是探索β2GPI在自身免疫性疾病中的结构与功能关系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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