重症肌无力单细胞组学数据

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重症肌无力单细胞组学数据

【一句话概览】

该数据集包含16名不同发病阶段和发病年龄的重症肌无力患者的单细胞组学数据，样本分两天在10X Genomics Chromium 3.0系统上采集，并在同一NovaSeq仪器同一次运行中完成测序。每天的数据经哈希标记后混合，每天各有三套文件，每套文件包含当天全部八名个体的混合细胞。每个细胞可获得RNA序列、B细胞受体序列、T细胞受体序列及RNA标记的表面蛋白结合抗体数据，后者包含10种谱系标记抗体及哈希抗体。文件总数为192个（来源 researchdata.se）。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis》。

【数据内容】

源站原始描述：This dataset is made up of single-cell omics files from 16 individuals with myasthenia gravis at various stages of the disease and with differing disease onset age. The samples have been acquired 8+8 on a 10X Genomics Chromium 3.0 system on two consecutive days and all sequenced in a NovaSeq instrument in the same run. For each of the two experimental days, the data has been hash-tagged and then mixed. Complicating the matter somewhat, there are three sets of files (= three 10X serial IDs) for e…

中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：该数据集由来自16名肌无力患者的单细胞组学文件组成，这些患者处于疾病的不同阶段，且发病年龄各异。样本在连续两天内使用10X Genomics Chromium 3.0系统以8+8的方式获取，并全部在同一台NovaSeq仪器上于同一次运行中完成测序。对于两天的实验，数据均经过哈希标记后混合。使情况稍显复杂的是，每天有三组文件（即三个10X序列ID），每组文件都包含来自当天八名个体的哈希混合细胞。此外，每个细胞可获得四种不同类型的数据：RNA序列（GE）、B细胞受体序列（ENRB）、T细胞受体序列（ENRT）以及RNA标记的表面蛋白结合抗体（HTO）。最后一部分包含一组10种谱系标记抗体以及哈希抗体。此外，考虑到每组文件由四个泳道组成，每个泳道每个方向有一个文件，文件总数为6x4x4x2=192个文件。以下是即将发表的论文摘要：自身免疫性肌无力症是一种与肌无力相关的神经肌肉接头疾病，其两个主要亚组为早发型和晚发型，分别定义为50岁之前或之后发病。两者均携带乙酰胆碱受体自身抗体，但在性别比例、遗传学及疾病特异性胸腺炎症的发生方面存在差异。通过应用多模态技术，包括深度光谱流式细胞表型分析和单细胞测序对外周血及胸腺细胞样本进行分析，我们探索了通过细胞免疫表型区分这两种形式的可能性。通过分析两个独立队列，我们确定了由三个主要淋巴细胞群体驱动的显著免疫学差异。在晚发型肌无力中观察到黏膜相关恒定T细胞和初始CD8 T细胞频率降低，提示免疫衰老增强。此外，早发型肌无力中高度分化的经典自然杀伤细胞群体减少，且与胸腺炎症程度呈负相关。仅使用这三个群体的频率，即可预测正确的肌无力亚组归属，准确率达90%。这些发现揭示了早发型与晚发型之间的差异性细胞免疫表型。

【主题与分类】

主题标签：Myasthenia gravis、single-cell omics、RNA sequencing、B-cell receptor、T-cell receptor、immunology、neurology、autoimmunity、peripheral blood mononuclear cells、thymocyte。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面：https://researchdata.se/en/catalogue/dataset/2025-247