PXD003656：VEGF诱导高通透性小鼠视网膜组织研究
本项目旨在识别视网膜血管高通透性的新型治疗靶点。研究对小鼠视网膜组织在Control、VEGF和Anti-VEGF三种条件下的样本进行全局蛋白质组分析，采用LC-MS/MS和Q Exactive，物种为Mus musculus（小鼠），并涉及视网膜血管高通透性主题（来源 ebi.ac.uk）
基本信息
资源简介
PXD003656：VEGF诱导高通透性小鼠视网膜组织研究
PXD003656 是一项围绕小鼠视网膜组织在 VEGF 诱导高通透性条件下开展的研究数据集，英文标题为 Mouse retinal tissue study in VEGF-induced hyperpermeability。项目目标在于识别视网膜血管高通透性的新型治疗靶点。研究对小鼠视网膜组织在 Control、VEGF 和 Anti-VEGF 三种条件下的样本进行全局蛋白质组分析，涉及的物种为 Mus musculus（小鼠），方法涉及 LC-MS/MS，并采用 Q Exactive。相关主题集中在视网膜血管高通透性、小鼠视网膜组织和 LC-MS/MS。数据来源为 ebi.ac.uk，并被归入眼及附器疾病 / 其他类别。以下从背景、内容、采集来源、适用场景、使用方法、质量限制以及引用许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
该研究的总体目标是在小鼠视网膜组织中识别视网膜血管高通透性的新型治疗靶点。项目说明指出，视网膜血管高通透性是关注核心，VEGF 诱导的高通透性构成研究标题中的重要条件背景。研究设计包含 Control、VEGF 和 Anti-VEGF 三种条件，并以小鼠视网膜组织作为研究样本。数据被归入眼及附器疾病 / 其他类别，说明其在分类上与眼及附器疾病相关。物种信息明确为 Mus musculus（mouse），并在受控词表中以 NEWT:10090 表示。关于更具体的疾病模型构建方式、VEGF 给药途径、Anti-VEGF 类型、干预时长或模型评价指标，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容是小鼠视网膜组织的全局蛋白质组分析。样本来自 Control、VEGF 和 Anti-VEGF 三种条件。项目说明称这些样本通过全局蛋白质组谱进行了较全面的表征。相关主题包括 LC-MS/MS、小鼠视网膜组织、视网膜血管高通透性，以及 Mus musculus（mouse）这一物种信息。受控词表中还出现 MS 相关标记，但其完整内容源站未展开。除上述信息外，源站未提供蛋白鉴定数量、定量结果、差异蛋白列表、原始文件数量、样本重复数、分组样本量或具体数据表结构。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk。相关信息提到采用 LC-MS/MS 和 Q Exactive，研究材料为小鼠视网膜组织，条件为 Control、VEGF 和 Anti-VEGF，物种为 Mus musculus（小鼠）。这些信息表明该数据集属于以质谱为基础的蛋白质组研究数据。除此之外，源站未提供样本采集地点、伦理审批信息、组织处理方式、蛋白提取与酶解方法、标记策略、色谱条件、质谱参数、数据采集软件、数据依赖采集设置或原始数据文件命名规则。
【适用场景】
基于研究目标，该数据集可用于关注视网膜血管高通透性新型治疗靶点识别的场景，也可用于围绕小鼠视网膜组织在 Control、VEGF 与 Anti-VEGF 条件下的全局蛋白质组变化进行探索。主题涉及 LC-MS/MS 和视网膜血管高通透性，因此适合与这些主题相关的数据检索和比较研究。源站未提供具体推荐分析场景、疾病模型适用范围、临床转化用途、与其他数据集的联合分析建议，也未说明可用于哪些特定工具或流程。
【使用方法】
关于该数据集的具体使用方法，源站未提供。没有给出下载入口、文件组织方式、文件格式、检索接口、重分析流程、复现步骤或推荐分析工具。若需进一步使用，应依据 ebi.ac.uk 上与该数据标识 PXD003656 对应的原始页面获取说明；但源站未提供本站侧的具体使用指南、数据预处理建议或分析参数设置。
【质量与限制】
源站未提供质量控制指标、样本量、重复数、统计效力、数据完整性、缺失值情况、批次效应、差异分析阈值、实验验证或独立验证情况。因此无法从现有信息判断该数据集的灵敏度、特异性、可重复性或具体局限。项目说明仅指出进行了全局蛋白质组表征，并未提供质量评价结论。关于该数据集的限制、偏差来源、适用范围边界和注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可协议、使用条款、版权归属、联系人或数据再分发限制。该数据集的标识为 PXD003656，标题为 Mouse retinal tissue study in VEGF-induced hyperpermeability，来源为 ebi.ac.uk。若需要正式引用或确认许可，源站未提供相应内容。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003656
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该项目旨在发现视网膜血管高通透性的新型治疗靶点。利用全蛋白质组分析，对三种条件（对照、VEGF和抗VEGF）下的小鼠视网膜组织样本进行了全面表征。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
