结核分枝杆菌休眠与复苏期蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001158

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

结核病由结核分枝杆菌引起，至今仍是全球重大健康问题。根除该病的主要障碍在于，该病原体能够在巨噬细胞内保持休眠，并在免疫受损条件下被重新激活。利用许多体外休眠模型，缺氧非复制型结核分枝杆菌的生理学已得到充分研究。然而，从休眠向有氧生长转变（再激活）过程中发生的生理变化却很少受到详细研究。在本研究中，我们通过重新通气使采用 Wayne 休眠模型诱导进入休眠的细菌复氧，建立了一个体外再激活系统，并使用非标记一维 LC/MS/MS 分析比较了休眠与再激活细菌的蛋白质组谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。