GIST蛋白质组数据集（人类胃肠道间质瘤亚型蛋白质组图谱）
该数据集是一个人类胃肠道间质瘤（GIST）的蛋白质组学数据集，包含基于质谱技术生成的肿瘤组织蛋白质表达谱，覆盖不同临床或分子亚型的样本，数据模态为蛋白质组学定量数据，主要用于GIST的分子分型、生物标志物筛选、肿瘤异质性研究以及精准医疗方向的探索。
基本信息
资源简介
GIST蛋白质组数据集（人类胃肠道间质瘤亚型蛋白质组图谱）
【一句话概览】
本数据集是 iProX 公开数据集，收录 60 个文件，主题涵盖 Quantitative proteomics、Homo sapiens、9606。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《GIST proteome dataset(Proteomic Maps of Human Gastrointestinal Stromal Tumor Subgroups)》。
【数据内容】
源站原始描述：Gastrointestinal stromal tumor (GIST) is a common sarcoma of gastrointestinal tract (GIT) with high metastatic and recurrence rates, but the proteomic features are still less understood. Here we performed systematic quantitative proteome profiling of GIST from 13 patients classified into very low/low, intermediate and high risk subgroups. An extended cohort of GIST (n = 131) was used for immunohistochemical validation of proteins of interest. In total, 10064 proteins were quantified, covering 61…
【数据结构与技术规格】
文件数 60 个。
【主题与分类】
主题标签：Quantitative proteomics、Homo sapiens、9606。
【获取与许可】
源站页面：https://www.iprox.cn/page/project.html?id=IPX0001353000
规范引用：30804049
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.iprox.cn/page/project.html?id=IPX0001353000
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个公开的人类胃肠道间质瘤（GIST）蛋白质组学资源，通过质谱等蛋白质组学技术构建，包含GIST不同亚型（如基于基因突变或临床特征划分的亚组）的蛋白质表达谱数据。数据涵盖肿瘤组织样本的蛋白质定量信息，可用于研究GIST的分子分型、生物标志物发现、肿瘤异质性以及靶向治疗机制，主要应用于肿瘤蛋白质组学、精准医学和生物信息学分析领域。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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