TGFb促进视裂融合及该过程中局部诱导BMP拮抗的必要性

视裂是发育中脊椎动物眼内的一个暂时性间隙,随着发育进行必须闭合。持续存在的视裂即眼组织缺损,是儿童失明的主要原因。尽管许多基因与眼组织缺损相关,但视裂融合过程仍鲜为人知,尤其是在分子层面

biostudies
浏览 7
时间序列眼组织缺损视裂融合TGFb2BMP拮抗细胞外基质重塑小鼠模型
TGFb-facilitated optic fissure fusion and the necessity of locally induced BMP antagonism during this process

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

TGFb促进视裂融合及该过程中局部诱导BMP拮抗的必要性

该数据集围绕脊椎动物胚胎期视裂闭合这一关键发育过程展开,聚焦转化生长因子β2(TGFb2)在视裂融合中的作用及其与骨形态发生蛋白(BMP)拮抗之间的分子联系。视裂是发育中脊椎动物眼内的一个暂时性间隙,随着发育进行必须闭合;若视裂持续存在,即形成眼组织缺损(coloboma),这是儿童失明的主要原因之一。尽管已有许多基因被证实与眼组织缺损相关,但视裂融合过程本身仍鲜为人知,尤其是在分子层面。本数据集所对应的研究在小鼠中鉴定出TGFb2靶向失活所致的眼组织缺损,并发现其视裂边缘虽已接触却未能融合,转录组分析提示细胞外基质重塑受到影响是潜在机制。数据集收录了与该研究相关的信息,可供关注眼发育、眼组织缺损分子机制的研究者参考。

【数据集背景】

视裂是发育中脊椎动物眼内的一个暂时性间隙,随着发育进行必须闭合。持续存在的视裂即眼组织缺损,是儿童失明的主要原因。尽管许多基因与眼组织缺损相关,但视裂融合过程仍鲜为人知,尤其是在分子层面。该数据集对应的研究正是在这一背景下展开:研究者在TGFb2靶向失活的小鼠中鉴定出眼组织缺损,并观察到视裂边缘相互接触但未能融合的现象,从而将研究焦点指向融合环节而非单纯的间隙维持。转录组分析进一步提示细胞外基质(ECM)重塑受影响是潜在机制。TGFb以ECM重塑能力著称,但同时常受到BMP信号的抑制;研究中还在下调基因中鉴定出两个BMP拮抗剂,为理解局部诱导的BMP拮抗在这一过程中的必要性提供了线索。

【数据内容】

该数据集英文名称为“TGFb-facilitated optic fissure fusion and the necessity of locally induced BMP antagonism during this process”,本站分类为眼病/眼组织缺损,来源站为ebi.ac.uk。从源站描述可知,数据集涉及的内容包括:小鼠中TGFb2靶向失活所致眼组织缺损的鉴定;视裂边缘接触但融合失败的表型观察;提示ECM重塑受影响的转录组分析结果;以及下调基因中两个BMP拮抗剂的鉴定。源站描述在“For further functional ana”处截断,后续功能分析的具体内容未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk。源站描述提及的研究对象为小鼠,采用TGFb2靶向失活模型,并结合转录组分析。除此之外,样本采集的具体时间、地点、实验流程与数据处理细节,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于眼发育与眼组织缺损相关的研究场景,尤其是视裂融合的分子机制研究、TGFb信号与ECM重塑在眼发育中的作用研究,以及BMP拮抗在视裂融合过程中必要性的功能研究。对于临床或遗传诊断类应用,源站未提供相应支持信息。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、文件格式、字段说明或分析流程。

【质量与限制】

源站描述在“For further functional ana”处中断,功能分析部分的完整信息缺失;数据集的样本量、测序深度、验证实验等质量相关指标,源站未提供。使用时应以源站原始记录为准。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-BSST80

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

S-BSST80 视裂是发育中脊椎动物眼内的一个暂时性间隙,随着发育进行必须闭合。持续性视裂,即眼组织缺损,是儿童失明的主要原因。尽管许多基因与眼组织缺损相关,但视裂融合的过程仍

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案