POEMS综合征基因表达谱数据
内分泌系统疾病领域表格公开数据集,来源:NCBI。

基本信息
资源简介
POEMS综合征基因表达谱数据
【一句话概览】
GEO DataSets 数据库存储经过整理的基因表达数据集,以及基因表达综合库(GEO)中的原始系列和平台记录。用户可输入检索词查找感兴趣的实验。数据集记录还包含聚类工具和差异表达查询等附加资源。该数据库涉及基因表达、功能基因组学、GEO 和表达谱分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《GEO DataSets》。
【数据内容】
源站原始描述:This database stores curated gene expression DataSets, as well as original Series and Platform records in the Gene Expression Omnibus (GEO) repository. Enter search terms to locate experiments of interest. DataSet records contain additional resources including cluster tools and differential expression queries
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该数据库存储了经过整理的基因表达数据集,以及基因表达综合数据库(GEO)存储库中的原始系列和平台记录。输入搜索词以定位感兴趣的实验。数据集记录包含额外的资源,如聚类工具和差异表达查询。
【主题与分类】
主题标签:gene expression、functional genomics、GEO、expression profiling。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含POEMS综合征患者与对照样本的基因表达谱数据,用于差异表达分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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