NHLBI TOPMed:萨摩亚人肥胖全基因组关联研究

研究设计为横断面、人群研究,本站归类于内分泌系统疾病下的肥胖症。数据可用于探索肥胖相关遗传变异与表型的关联,支持肥胖遗传学及人群特异性风险研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
浏览 7
基因组分类Cross-Sectional, Population
phs000972: NHLBI TOPMed: Genome-wide Association Study of Adiposity in Samoans

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

NHLBI TOPMed:萨摩亚人肥胖全基因组关联研究

phs000972 是 NCBI dbGaP 收录的一项关于萨摩亚人群肥胖性状的全基因组关联研究,英文全称为 NHLBI TOPMed: Genome-wide Association Study of Adiposity in Samoans。该研究采用横断面、人群研究设计,在本站被归类于内分泌系统疾病下的肥胖症。围绕肥胖相关遗传变异与表型的关联,该数据集可用于肥胖遗传学及人群特异性风险研究,为理解萨摩亚人群肥胖的遗传基础提供数据支持。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集属于 NHLBI TOPMed 计划框架下针对萨摩亚人群肥胖性状开展的全基因组关联研究。肥胖症在内分泌系统疾病中占有重要位置,其发生涉及遗传与环境的多重因素。选择萨摩亚人群作为研究对象,使该数据集具备人群特异性研究的价值,可用于探索该人群肥胖相关遗传变异与表型之间的关联。研究设计为横断面、人群研究,这一设计特征决定了数据在时点上对人群状态的刻画方式。源站将其描述为 dbGaP study,属于 dbGaP 收录的研究项目。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Cross-Sectional 与 Population,对应横断面与人群研究两个维度。其核心内容围绕肥胖性状的全基因组关联分析展开,涉及肥胖相关遗传变异与表型的关联信息。本站将其归类于内分泌系统疾病下的肥胖症,明确了其在疾病分类体系中的位置。关于具体的样本量、遗传标记数量、表型指标种类、数据文件格式与规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,具体为 dbGaP 收录的研究项目,源站描述其为 Cross-Sectional, Population 研究。数据由 NHLBI TOPMed 计划下的相关研究产生,研究对象为萨摩亚人群。关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批与知情同意流程等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其横断面、人群研究的设计特征与肥胖症的主题定位,该数据集适用于探索肥胖相关遗传变异与表型之间的关联,支持肥胖遗传学及人群特异性风险研究。研究者可将其用于萨摩亚人群肥胖遗传基础的考察,也可在人群特异性遗传风险研究的框架下使用。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 NCBI dbGaP 平台发布,属于 dbGaP study。关于数据访问权限的申请流程、受控访问与开放访问的划分、下载方式、配套分析工具与文档说明等具体使用信息,源站未提供。

【质量与限制】

该研究为横断面设计,这一设计本身在时点刻画上具有固有特征。关于样本质量评估、基因型质控指标、缺失数据处理、人群分层校正以及统计效力等方面的具体信息,源站未提供。使用时应结合研究设计特征对结果解释加以考量。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台。关于具体的引用格式、数据使用协议、许可条款与再分发规定等信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000972

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Cross-Sectional, Population).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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