phs000914:萨摩亚人肥胖全基因组关联研究

该数据集为 dbGaP 收录的 phs000914 研究,主题为萨摩亚人肥胖的全基因组关联研究,属于内分泌系统疾病下的肥胖症方向

dbgap
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基因组分类Cross-Sectional, Population
phs000914: Genome-wide Association Study of Adiposity in Samoans

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000914:萨摩亚人肥胖全基因组关联研究

该数据集为 dbGaP 收录的 phs000914 研究,英文名称为 Genome-wide Association Study of Adiposity in Samoans,主题为萨摩亚人肥胖的全基因组关联研究。按照本站分类,它归属于内分泌系统疾病下的肥胖症方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站将其描述为一项 dbGaP 研究,研究设计属于横断面、人群研究,主题标签同样为横断面与人群。整体来看,该数据集围绕萨摩亚人群的肥胖性状开展全基因组关联分析,可用于探索与肥胖相关的遗传变异,属于遗传流行病学与内分泌代谢疾病交叉领域的研究资源。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦于萨摩亚人群的肥胖问题。肥胖属于内分泌系统疾病范畴,而全基因组关联研究是识别与复杂性状相关遗传变异的常用策略。将研究对象限定为萨摩亚人,意味着该研究关注特定人群中的肥胖遗传基础。源站将其登记为 dbGaP 研究,说明其属于受控访问的基因型与表型数据库体系中的一项研究。研究设计为横断面、人群研究,表明其数据采集方式为在某一时间点上对人群样本进行观察,而非长期随访。上述信息构成了该数据集的基本背景。

【数据内容】

该数据集的主题为萨摩亚人肥胖的全基因组关联研究。其核心内容应围绕全基因组关联分析展开,涉及肥胖相关性状与遗传变异的关联。源站描述仅给出“dbGaP study (Cross-Sectional, Population)”这一层级的信息,主题标签为横断面与人群。关于具体的样本量、基因分型平台、表型测量指标、变异位点数量、统计分析方法及结果摘要等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究,编号为 phs000914。源站将其描述为一项横断面、人群研究。关于具体的招募方式、采样地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息以及数据提交机构等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与设计,该数据集适用于与萨摩亚人群肥胖遗传学相关的研究场景,例如在全基因组关联分析框架下探讨肥胖相关性状的遗传关联,或作为特定人群遗传流行病学研究的参考数据。由于源站将其标注为横断面、人群研究,其适用场景也应限定在横断面人群研究的范围内。关于该数据集是否适用于纵向分析、跨人群比较或临床预测等具体用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 dbGaP 收录的研究,通常需要通过 dbGaP 的受控访问流程申请使用。关于该数据集的具体申请条件、访问级别、下载方式、数据格式、配套分析工具及使用协议等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为横断面、人群研究,这一设计本身意味着其数据反映的是某一时间点的人群状况,在因果推断方面存在固有局限。此外,研究聚焦于萨摩亚人群,其结论向其他人群外推时需谨慎。关于该数据集的具体样本代表性、基因型数据质量、表型测量误差、缺失情况、统计效力及已知偏倚等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP,研究编号为 phs000914。关于具体的引用格式、致谢要求、数据使用许可条款、访问授权范围及再分发限制等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000914

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Cross-Sectional, Population).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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