GAS6下调损害滑膜巨噬细胞胞葬作用并促进肥胖相关骨关节炎

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A9edd422b9f9920eb5aa0a099e15a8f72e646def0df90014fb223d7e4a5a120a2

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肥胖一直被认为是骨关节炎（OA）进展的重要危险因素，但肥胖相关炎症在OA滑膜炎中的潜在机制仍不清楚。本研究发现，滑膜巨噬细胞在肥胖微环境中发生浸润和极化，并通过肥胖相关OA的病理学分析确定了M1巨噬细胞在巨噬细胞胞葬作用受损中的关键作用。本研究揭示，肥胖OA患者和Apoe-/-小鼠表现出更明显的滑膜炎和滑膜组织中增强的巨噬细胞浸润，并伴有占优势的M1巨噬细胞极化。与对照组OA小鼠相比，肥胖OA小鼠具有更严重的软骨破坏和更高水平的滑膜凋亡细胞。肥胖滑膜中增强的M1极化巨噬细胞减少了生长停滞特异性蛋白6（GAS6）的分泌，导致滑膜凋亡细胞中巨噬细胞胞葬作用受损。积累的凋亡细胞释放的细胞内内容物……我们确认已获得本研究所有人类参与者的书面知情同意。

知情同意过程明确包括允许收集生物样本，并允许将由此产生的去标识化数据在公共领域发表。去标识化方法：为保护参与者隐私，已从数据集中移除所有直接个人标识符（包括姓名、病历号、出生日期和联系信息）。1）编码：样本被分配唯一的、不可识别的字母数字代码（例如“HE_Normal_OA_patients”、“SFO_Obese individuals”），或按临床表型分组（例如“Obese OA”）。将这些代码与原始患者身份相关联的密钥由研究者单独安全保存，未包含在本提交材料中。2）影像数据：所提供的图像为高倍显微组织学和免疫荧光视野。它们不包含任何面部特征或其他生物

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。