Men1基因敲除小鼠全外显子组测序数据

数据集获取

源站：https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=072deea5c65e4b208f1bc8f51997dae1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含Men1基因敲除小鼠模型的全外显子组测序数据。数据来源于通过他莫昔芬诱导的Men1f/f;UBC-Cre小鼠，在诱导后12个月采集的肿瘤组织、瘤旁正常组织以及对照小鼠的正常肺组织。测序由诺禾致源（北京）完成，采用Covaris M220剪切、Agilent SureSelect Human All Exon V5/V6建库、RNA探针杂交捕获以及Illumina HiSeq平台测序。生物信息分析流程包括BWA比对、Sambamba去重复、SAMtools检测SNP/INDEL、muTect/Strelka检测体细胞突变、control-FREEC分析拷贝数变异、ANNOVAR注释以及MuSic进行突变特征和通路富集分析。该数据集主要用于研究多发性内分泌腺瘤病1型（MEN1）的肿瘤发生机制、体细胞突变谱和基因组变异特征，适用于肿瘤基因组学、基因功能与疾病模型等领域。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。