成釉细胞瘤的微阵列与生物信息学分析

该数据集聚焦成釉细胞瘤的基因表达微阵列和生物信息学分析,包含通过芯片技术获得的376个上调基因表达数据、蛋白质相互作用网络分析结果以及RT-qPCR和免疫组织化学验证数据,主要数据模态为基因表达谱和临床验证信息,旨在识别成釉细胞瘤的关键致病基因和潜在治疗靶点,为口腔肿瘤的分子机制研究和精准医疗提供数据基础。

National Autonomous University of Mexico; Universidad Nacional Autónoma de MéxicoNational Autonomous University of Mexico; Universidad Nacional Autónoma de México
SciELO Data
2022-12-20 更新
浏览 11
肿瘤基因组学精准医疗靶点发现

基本信息

创建/更新时间
2022-12-20

资源简介

该数据集基于成釉细胞瘤(一种高侵袭性牙源性肿瘤)的基因表达微阵列和生物信息学分析研究构建。数据集内容包括通过CHIP H10KA芯片和DAVID软件获得的376个上调基因的表达数据,以及通过STRING-Cytascape与MCODE插件构建的蛋白质-蛋白质相互作用网络分析结果。研究进一步采用RT-qPCR和免疫组织化学(IHC)验证了候选基因(如PDGFA和IL2RA)的表达情况。该数据集主要应用于口腔肿瘤的分子机制探索、关键致病基因识别以及潜在治疗靶点(如PDGFA)的发现,为成釉细胞瘤的精准医疗研究提供数据支持。

原始链接

https://data.scielo.org/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.48331/SCIELODATA.Z2S8X9

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数据说明

该数据集基于成釉细胞瘤(一种高侵袭性牙源性肿瘤)的基因表达微阵列和生物信息学分析研究构建。数据集内容包括通过CHIP H10KA芯片和DAVID软件获得的376个上调基因的表达数据,以及通过STRING-Cytascape与MCODE插件构建的蛋白质-蛋白质相互作用网络分析结果。研究进一步采用RT-qPCR和免疫组织化学(IHC)验证了候选基因(如PDGFA和IL2RA)的表达情况。该数据集主要应用于口腔肿瘤的分子机制探索、关键致病基因识别以及潜在治疗靶点(如PDGFA)的发现,为成釉细胞瘤的精准医疗研究提供数据支持。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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