泪液脂质组学揭示炎症性干眼病相关的眼表脂质代谢重塑
该数据集来自 omicsdi.org,围绕炎症性干眼病(DED)是否伴随眼表脂质代谢异常重塑展开。研究采集 DED 患者与匹配健康对照的泪液样本,采用 LC–MS/MS 进行脂质组学分析,并使用标准化采集与计算分析流程

基本信息
资源简介
泪液脂质组学揭示炎症性干眼病相关的眼表脂质代谢重塑
该数据集来自 omicsdi.org,围绕炎症性干眼病(DED)是否伴随眼表脂质代谢异常重塑展开。研究采集 DED 患者与匹配健康对照的泪液样本,采用 LC–MS/MS 进行脂质组学分析,并使用标准化采集与计算分析流程。全局非靶向代谢组分析显示 DED 组泪液脂质组成发生广泛改变;PCA 与 OPLS-DA 等多变量统计建模可将 DED 与对照清晰区分,非监督层次聚类进一步识别出可重复的疾病特异性脂质组学特征。数据可用于探索 DED 相关脂质代谢标志物与分型(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在探究炎症性干眼病(DED)是否伴随眼表脂质代谢异常重塑。采集 DED 患者与匹配健康对照的泪液样本。采用 LC–MS/MS 进行脂质组学分析,并使用标准化的采集与计算分析流程。全局非靶向代谢组分析显示,相对于对照,DED 组泪液脂质组成发生广泛改变。包括主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)在内的多变量统计建模显示 DED 与对照队列之间清晰分离,证实 DED 具有独特的代谢表型。非监督层次聚类进一步识别出可重复的疾病特异性脂质组学特征。显著失调的代谢物
【主题与分类】
主题标签:Metabolomics。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS14218
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探讨炎症性干眼病(DED)是否伴随眼表脂质代谢重塑异常。收集DED患者及匹配健康对照者的泪液样本。采用LC–MS/MS进行脂质组学分析,并使用标准化的采集与计算分析工作流程。全局非靶向代谢组学分析显示,与对照组相比,DED组泪液脂质组成发生广泛改变。多变量统计建模,包括主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA),显示DED与对照队列之间清晰分离,证实DED具有独特的代谢表型。无监督层次聚类进一步识别出可重复的疾病特异性脂质组学特征。显著失调的代谢物包括多种脂质类别,尤其是鞘脂、磷脂酰胆碱(PCs)和溶血磷脂。
在机制上,差异调控的脂质种类汇聚于协调控制内质网-线粒体脂质交互的功能模块,包括MAM依赖性磷脂流(PC/PE/PI/PS)、中性脂质缓冲(TG/DG)以及鞘脂炎症门控(Cer/SM)。通路富集分析显示,DED样本中升高的脂质主要与脂质代谢和鞘脂代谢通路相关。该数据集为理解炎症性干眼病眼表脂质代谢重编程提供了全面资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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