揭示基于DESI的空间代谢组学中的隐藏变量：溶剂组成与组织类型作为关键驱动因素

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS14771

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数据说明

在开发用于空间代谢组学的解吸电喷雾电离（DESI）工作流程时，我们研究了两种常用溶剂系统——90%乙腈（ACN）和90%甲醇（MeOH）——对多种小鼠组织空间代谢组学分析的影响。我们评估了这两种溶剂在几种代谢物类别（中心碳代谢物、氨基酸和脂肪酸）中的性能。基于ACN的溶剂系统对参与糖酵解、三羧酸（TCA）循环和氨基酸代谢的小极性代谢物产生了更高的信号强度，而基于MeOH的溶剂系统则对脂肪酸提供了更高的信号强度。这些发现表明，溶剂组成对DESI中的代谢物提取和电离过程有不同的影响，应仔细匹配生物学问题和感兴趣的代谢物类别。为了说明优化工作流程的实用性，我们将ACN溶剂系统应用于大鼠肾缺血损伤模型。

代谢物在肾脏不同区域（皮质、外髓质和内髓质）的空间分布图谱显示，常氧与缺血条件下存在显著的区域特异性代谢变化。总之，这些结果证明了溶剂选择在基于DESI的空间代谢组学中的重要性，并展示了该方法揭示与组织损伤相关的空间分辨代谢适应的能力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。