肝硬化难治性腹水患者肠道菌群结构与代谢功能整合分析数据集
本研究结合16S rRNA测序与基于GC-MS的非靶向代谢组学，探究70例肝硬化难治性腹水患者（OB组）和70例健康个体（NC组）的肠道微生物组成与代谢物谱
基本信息
资源简介
肝硬化难治性腹水患者肠道菌群结构与代谢功能整合分析数据集
PRJDB39337（PRJCA045355）是一项针对肝硬化难治性腹水患者肠道微生态的研究数据集，英文全称为 Integrated analysis of gut microbiota structure and metabolic function in patients with cirrhosis and refractory ascites。该研究将 16S rRNA 测序与基于 GC-MS 的非靶向代谢组学相结合，系统考察肝硬化难治性腹水患者与健康个体在肠道微生物组成及代谢物谱上的差异。研究对象包括 70 例肝硬化难治性腹水患者（OB 组）和 70 例健康个体（NC 组），分析内容涵盖微生物多样性评价、分类学比较、功能预测、代谢物筛选以及疾病关联映射。该数据集在站内归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他分类，来源站为 ebi.ac.uk，可为肠道菌群与代谢功能相关研究提供参考。
【数据集背景】
肝硬化难治性腹水是肝硬化进展过程中的严重并发症，其发生发展可能与肠道微生态失衡及代谢功能改变相关。该研究以肝硬化难治性腹水患者为对象，设置健康个体作为对照，旨在从肠道微生物结构与代谢功能两个层面开展整合分析，以刻画患者群体肠道菌群组成和代谢物谱的特征，并探索其与疾病的关联。研究采用 16S rRNA 测序获取微生物组成信息，同时采用基于 GC-MS 的非靶向代谢组学获取代谢物谱，两者结合形成对肠道微生态结构与功能的综合观察。
【数据内容】
该数据集围绕 70 例肝硬化难治性腹水患者（OB 组）和 70 例健康个体（NC 组）展开，包含 16S rRNA 测序数据与基于 GC-MS 的非靶向代谢组学数据。研究分析内容包括微生物多样性评价、分类学比较、功能预测、代谢物筛选和疾病关联映射。上述分析覆盖了从微生物群落结构描述到代谢功能预测、再到代谢物差异筛选及疾病关联分析的多个环节，构成肠道菌群结构与代谢功能的整合分析框架。除源站描述所提及的测序与代谢组学数据类型及分析内容外，样本的具体临床信息、测序平台型号、代谢物鉴定数量等细节源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，数据集英文名称为 PRJDB39337: Integrated analysis of gut microbiota structure and metabolic function in patients with cirrhosis and refractory ascites (PRJCA045355)。研究样本来自 70 例肝硬化难治性腹水患者（OB 组）和 70 例健康个体（NC 组）。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体纳入排除标准，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肠道微生态与肝硬化难治性腹水相关的研究场景，包括肠道微生物组成与多样性的比较分析、微生物群落分类学差异考察、微生物功能预测、基于 GC-MS 的非靶向代谢组学代谢物筛选，以及肠道菌群与代谢物同疾病状态的关联映射分析。也可作为同类研究中健康对照与疾病组肠道菌群及代谢物谱比较的参考数据。由于数据集同时包含微生物组与代谢组两个层面，适合开展菌群结构与代谢功能的整合分析。具体适用研究设计需结合源站提供的数据内容确定。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕 16S rRNA 测序数据开展微生物多样性评价和分类学比较，并在此基础上进行功能预测；围绕 GC-MS 非靶向代谢组学数据开展代谢物筛选；进而将微生物组分析结果与代谢组分析结果结合，进行疾病关联映射。分析时应明确区分 OB 组与 NC 组，以保证组间比较的对应关系。关于数据文件格式、预处理流程、分析软件与参数设置等具体操作信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含 70 例肝硬化难治性腹水患者与 70 例健康个体，两组样本量相同，便于开展组间比较。研究采用 16S rRNA 测序与 GC-MS 非靶向代谢组学相结合的策略，分析内容涵盖多样性评价、分类学比较、功能预测、代谢物筛选和疾病关联映射。需要说明的是，16S rRNA 测序的功能预测属于预测性分析，非靶向代谢组学在代谢物鉴定方面存在固有局限；此外，该研究的样本来源、临床背景信息及具体实验条件等细节源站未提供，使用时应结合源站信息评估其适用性。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ebi.ac.uk，数据集标识为 PRJDB39337（PRJCA045355）。关于数据集的引用方式、许可协议及使用条款，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB39337
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究结合16S rRNA测序与基于GC-MS的非靶向代谢组学，对70例肝硬化顽固性腹水患者（OB组）和70名健康个体（NC组）的肠道微生物组成及代谢物谱进行了探究。分析内容包括微生物多样性评估、分类学比较、功能预测、代谢物筛选及疾病关联映射。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
