MTBLS15555:酿酒酵母衰老相关突变体与果蝇宿主相互作用的综合非靶向代谢组学数据集
本数据集为内分泌系统疾病领域的其他公开数据集,来源:metabolights。

基本信息
资源简介
MTBLS15555:酿酒酵母衰老相关突变体与果蝇宿主相互作用的综合非靶向代谢组学数据集
MTBLS15555 是一个关于酿酒酵母衰老相关突变体及其与黑腹果蝇宿主相互作用的综合性非靶向代谢组学数据集。该数据集聚焦于衰老这一受遗传因素、环境条件以及生物与相关微生物相互作用共同影响的复杂生物学过程,利用芽殖酵母酿酒酵母和果蝇这两种互补的模式系统,刻画与衰老和长寿相关的保守代谢过程。研究通过液相色谱–质谱(LC–MS)技术,对包括 BY4743 对照菌株在内的 15 株酵母菌株进行了代谢组学分析,旨在揭示衰老相关微生物遗传改变如何影响宿主代谢状态,为相关研究提供代谢组学资源。
【数据集背景】
衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母酿酒酵母和果蝇为研究衰老与长寿相关的保守代谢过程提供了互补的模式系统。然而,描述衰老相关微生物遗传改变如何影响宿主代谢状态的综合性代谢组学资源仍然有限。在此背景下,该研究构建了综合性非靶向代谢组学数据集,用于表征与衰老相关的酿酒酵母缺失菌株及其与黑腹果蝇宿主相互作用所伴随的代谢改变。
【数据内容】
该数据集包含基于液相色谱–质谱(LC–MS)的代谢组学图谱,覆盖 15 株酵母菌株,其中包括 BY4743 对照菌株。数据集英文全称为“Comprehensive Untargeted Metabolomics Dataset of Saccharomyces cerevisiae Aging-Associated Mutants and Yeast–Host Interactions in Drosophila melanogaster”。在本站分类中,该数据集归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”类别。关于数据文件中具体包含的样本数量、代谢物鉴定数目、原始数据格式与文件结构等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。其代谢组学数据通过液相色谱–质谱(LC–MS)平台采集,分析对象为 15 株酿酒酵母菌株,包括 BY4743 对照菌株,并涉及这些酵母与黑腹果蝇宿主之间的相互作用。关于具体的样品制备流程、色谱与质谱参数、实验批次设计以及数据采集时间等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究与衰老和长寿相关的保守代谢过程,特别是衰老相关微生物遗传改变对宿主代谢状态的影响。由于同时涉及酿酒酵母突变体与黑腹果蝇宿主相互作用,该数据可用于比较不同酵母缺失菌株的代谢谱差异,探索微生物遗传因素与宿主代谢之间的关联,并可作为代谢组学方法开发、数据整合分析或衰老相关生物标志物研究的参考资源。关于该数据集在其他具体研究场景中的验证性应用,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以非靶向 LC–MS 代谢组学图谱的形式提供,使用者可依据源站提供的访问方式进行获取与下载。关于数据的具体使用许可、分析流程建议、代谢物注释信息以及配套元数据说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 LC–MS 非靶向代谢组学方法生成,涵盖 15 株酵母菌株,包括 BY4743 对照菌株。关于数据质量评估指标、缺失值比例、批次效应校正情况、代谢物鉴定置信度以及数据集本身的局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与使用许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS15555
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
衰老是一个复杂的生物学过程,受遗传因素、环境条件以及生物体与其相关微生物之间相互作用的影响。芽殖酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和果蝇(Drosophila melanogaster)为研究与衰老和长寿相关的保守代谢过程提供了互补的模式系统。然而,描述衰老相关微生物遗传改变如何影响宿主代谢状态的综合性代谢组学资源仍然有限。在本研究中,我们生成了一个全面的非靶向代谢组学数据集,以表征与衰老相关的酿酒酵母缺失菌株及其与果蝇宿主相互作用相关的代谢改变。该数据集包括来自15株酵母菌株的基于液相色谱-质谱联用(LC–MS)的代谢组学图谱,其中包括BY4743对照菌株和14株衰老相关缺失菌株,以及暴露于不同酵母干预的果蝇组织的宿主代谢组学图谱。
宿主样本包括在不同生命阶段采集的肠道和非肠道组织,可用于评估组织特异性和年龄相关的代谢对酵母遗传扰动的响应。所生成的数据集包含原始和处理后的代谢组学数据、代谢物注释信息,以及描述生物学条件、遗传背景、组织来源、干预组和实验参数的全面样本元数据。这些数据为研究酵母来源的代谢调控、微生物-宿主相互作用以及年龄相关的代谢重塑提供了可重复使用的资源。该代谢组学资源有助于对微生物遗传变异、宿主代谢适应和保守的衰老相关通路进行整合分析,并支持未来对微生物因子与宿主生理之间分子联系的研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




