MTBLS15543:围产期奶牛产前高剂量丙酸铬补充的直肠内容物代谢组学分析

本数据集为内分泌系统疾病领域的其他公开数据集,来源:metabolights。

metabolights
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其他回归代谢组学LC-MS/MS围产期奶牛丙酸铬直肠内容物内分泌与代谢
MTBLS15543: Rectal-content metabolomic profiling of periparturient dairy cows supplemented with high-dose chromium propionate before calving

基本信息

模态
其他
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

MTBLS15543:围产期奶牛产前高剂量丙酸铬补充的直肠内容物代谢组学分析

MTBLS15543 是一项针对围产期奶牛的直肠内容物代谢组学研究数据集,聚焦于产犊前高剂量丙酸铬补充对后肠道代谢反应的影响。该数据集收录了在产犊当天从荷斯坦奶牛采集的直肠内容物样本的非靶向 LC-MS/MS 代谢组学图谱,样本分别来自对照组和高剂量丙酸铬补充组。研究中,奶牛从预计产犊前 21 天起至分娩,接受不含补充丙酸铬的基础全混合日粮,或接受相同日粮但每头每天补充 20 克丙酸铬(提供每头每天 8 毫克 Cr(III))。该数据集在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病 / 其他,来源于 ebi.ac.uk,可用于考察围产期日粮干预与后肠道代谢特征之间的关联。

【数据集背景】

围产期是奶牛生理与代谢状态发生显著变化的阶段,产犊前后的营养管理对动物健康和生产表现具有重要影响。丙酸铬作为一种铬补充形式,其在围产期奶牛日粮中的应用受到关注。本研究围绕产犊前补充高剂量丙酸铬这一干预措施,采集产犊当天的直肠内容物样本,通过非靶向 LC-MS/MS 代谢组学分析,刻画后肠道代谢响应,为理解围产期营养干预与后肠道代谢之间的关系提供数据基础。该数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 其他,体现了其与营养代谢研究领域的关联。

【数据内容】

该数据集的核心内容是直肠内容物样本的非靶向 LC-MS/MS 代谢组学图谱。样本采集于产犊当天,来自荷斯坦奶牛,涵盖对照组和高剂量丙酸铬补充组。研究设计中的日粮处理包括:基础全混合日粮不添加丙酸铬,或在相同日粮基础上每头每天补充 20 克丙酸铬,提供每头每天 8 毫克 Cr(III);补充期从预计产犊前 21 天持续至分娩。数据集所包含的具体代谢物数量、鉴定结果、统计比较结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

样本为直肠内容物,于产犊当天以无菌方式采集。研究对象为荷斯坦奶牛,分为对照组和高剂量丙酸铬补充组。干预从预计产犊前 21 天开始,持续至分娩。样本分析采用非靶向 LC-MS/MS 代谢组学方法,旨在表征与产犊前丙酸铬补充相关的后肠道代谢反应。数据来源站为 ebi.ac.uk。样本量、采集地点、具体仪器参数等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围产期奶牛营养代谢研究相关场景,例如探讨产犊前丙酸铬补充对后肠道代谢谱的影响、比较对照组与补充组在产犊当天的直肠内容物代谢特征,以及作为代谢组学数据用于方法学参考或与其他围产期奶牛代谢研究进行对照分析。由于数据涉及内分泌、营养和代谢疾病 / 其他分类,也可为营养干预与代谢变化关联的研究提供数据素材。具体适用分析类型需结合源站提供的完整信息确定,源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据分组信息(对照组与高剂量丙酸铬补充组)对产犊当天采集的直肠内容物非靶向 LC-MS/MS 代谢组学图谱进行组间比较,考察与丙酸铬补充相关的代谢特征差异。分析中应结合研究设计中的日粮处理细节,即补充剂量为每头每天 20 克丙酸铬、提供每头每天 8 毫克 Cr(III),补充期为预计产犊前 21 天至分娩。具体的数据格式、预处理流程、统计方法及分析工具等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于产犊当天采集的直肠内容物样本和非靶向 LC-MS/MS 代谢组学分析,样本来源明确、分组设计清晰。但数据仅反映产犊当天的时间点,未涵盖其他时间点的纵向变化;样本量、代谢物鉴定置信度、缺失值情况、批次效应等信息,源站未提供。使用时应关注非靶向代谢组学数据在定性和定量方面的固有不确定性,以及研究结论向其他群体或饲养条件外推时的局限性。源站未提供更详细的质量控制信息。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,英文名称为 MTBLS15543: Rectal-content metabolomic profiling of periparturient dairy cows supplemented with high-dose chromium propionate before calving。具体的引用格式、作者列表、发表信息及许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/metabolights/MTBLS15543

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究包含对照组和高剂量丙酸铬补充组荷斯坦奶牛在产犊当天采集的直肠内容物样本的非靶向LC-MS/MS代谢组学图谱。从预期产犊前21天至分娩,奶牛接受以下两种日粮之一:不含丙酸铬补充的基础全混合日粮,或相同日粮但每头每天补充20 g丙酸铬,每头每天提供8 mg Cr(III)。直肠内容物样本在产犊时无菌采集,并进行分析,以表征围产期期间与产前补充丙酸铬相关的后肠代谢反应。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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