E4F1与MPC1敲低后猪卵巢颗粒细胞的靶向代谢组分析

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦猪卵巢颗粒细胞在 E4F1 与 MPC1 敲低后的靶向代谢组变化,包含 1 个系列矩阵文件

geo
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基因组回归GPL345889823
GSE350358: Targeted Metabolomic Profiling of Porcine Ovarian Granulosa Cells Following E4F1 and MPC1 Knockdown

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

E4F1与MPC1敲低后猪卵巢颗粒细胞的靶向代谢组分析

GSE350358 数据集来自 NCBI GEO,题为“Targeted Metabolomic Profiling of Porcine Ovarian Granulosa Cells Following E4F1 and MPC1 Knockdown”,即针对猪卵巢颗粒细胞在 E4F1 与 MPC1 敲低后开展的靶向代谢组分析。该数据集属于内分泌、营养和代谢疾病及其他相关分类,包含 1 个系列矩阵文件 GSE350358_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供。其核心用途是支撑对 E4F1 和 MPC1 在猪卵巢颗粒细胞代谢稳态调控中所起作用的考察,适合关注卵巢颗粒细胞代谢变化、基因敲低效应以及靶向代谢组数据读取与二次分析的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集围绕猪卵巢颗粒细胞展开,研究目的是考察 E4F1 与 MPC1 两个基因在调节这类细胞代谢稳态中的作用,所采用的技术路线为靶向代谢组分析。卵巢颗粒细胞是卵泡中的重要体细胞类型,其代谢状态与卵泡发育和内分泌功能密切相关,因此针对 E4F1 与 MPC1 敲低后代谢谱变化的研究,具有明确的内分泌与代谢研究背景。数据集在分类上归入内分泌、营养和代谢疾病及其他类别,与其研究主题相符。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE350358_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件,并以 GZIP 压缩包形式分发。主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL34588 与 9823。源站未提供矩阵文件中具体包含的样本数量、代谢物条目数、分组设计细节及具体检测指标数值,因此无法进一步描述数据表的字段构成与规模。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。作者为 Mengfan,Qi,发布时间为 Oct 10 202。源站描述说明,该研究旨在利用靶向代谢组分析考察 E4F1 和 MPC1 在调控猪卵巢颗粒细胞代谢稳态中的作用。除上述来源信息外,源站未提供样本采集、处理与仪器检测的详细流程。

【适用场景】

该数据集可用于了解猪卵巢颗粒细胞在 E4F1 与 MPC1 敲低条件下的靶向代谢组变化,适合作为内分泌与代谢相关研究中关于颗粒细胞代谢稳态的参考数据。对于需要练习或验证代谢组系列矩阵文件读取、字段核对与批量接入流程的使用者,该数据集也可作为示例数据。源站未提供该数据集在其他具体研究场景中的适用性说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE350358_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。源站未提供具体的分析软件、参数设置或标准化处理步骤。

【质量与限制】

该数据集仅有 1 个系列矩阵文件,源站未提供样本量、重复数、缺失值情况、批次信息及质量控制指标,因此无法对其数据质量作出具体评价。使用时应以源站记录为准,并在分析前自行核对文件内容与编码。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用规范与许可条款。使用或再分发前,应查阅 NCBI GEO 对应页面以获取最新的引用与使用要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE350358

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在利用靶向代谢组学分析,探讨E4F1和MPC1在调控猪卵巢颗粒细胞代谢稳态中的作用。

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